Buik Object-georiënteerde Python-bibliotheek voor onderzoek naar structurele bio-informatica
Download nu

Buik Rangschikking & Samenvatting

Buik Tags

analyseren automatiseren Analyseer de moleculaire structuur Bio-informatic onderzoeksbibliotheek moleculaire structuur

Buik Beschrijving

Object-georiënteerde Python-bibliotheek voor onderzoek naar structurele bio-informatica Biskit is een gratis en open source Python-bibliotheek die intuïtieve klassen biedt voor vele typische taken van structureel bioinformatiekonderzoek. Biskit faciliteert de manipulatie en analyse van macromoleculaire structuren, eiwitcomplexen en moleculaire dynamics-trajecten. Tegelijkertijd biedt Biskit een softwareplatform voor de snelle integratie van externe programma's en nieuwe algoritmen in complexe structurele bio-informatiekworkflows. Berekeningen worden dus vaak gedelegeerd aan gevestigde programma's zoals Xplor, Amber, HEX, PROSA en HMMER; Interfaces tot verdere software kunnen eenvoudig worden toegevoegd. Bovendien vereenvoudigt Biskit de parallelisatie van berekeningen via PVM (parallelle virtuele machine). Een paar voorbeelden van wat u kunt doen met Biskit: · Analyseer moleculaire structuren, complexen en moleculaire dynamiekwegbejecten · Geautomatiseerde conforme bemonstering · Geautomatiseerde homologie-modellering · Multi-Model-eiwit. -Protein (kruis-) docking · quasiharmonische entropie berekeningen · Paralleliseer en automatiseer uw eigen vereisten voor structurele bio-informatica: · Python Wat is er nieuw in deze release: · Teruggekeerd in Setup.py Terug naar het gebruik van Distutils · Zorg voor aparte setup_ez.py voor de vorige easyinstall / Setuptools-installatie · Hernoem bispy-script naar bis.py om problemen met setuptools-installaties te vermijden. · Hernoem Documentation Folder Biskit / Documenten naar Biskit / Doc

Buik Gerelateerde software