Mac5 Een programma voor fylogenetische reconstructie met behulp van Gapped-gegevens
Download nu

Mac5 Rangschikking & Samenvatting

Mac5 Tags

schatting reconstrueren reconstrueer fylogenie Phylogeny-reconstructie Phylogenetische boomschatter fylogenie

Mac5 Beschrijving

Een programma voor fylogenetische reconstructie met behulp van Gapped-gegevens MAC5 is een programma dat MCMC-bemonstering implementeert om een fylogenetische boom uit een DNA-meervoudige uitlijning te kunnen schatten. Wat MAC5 van vergelijkbare programma's onderscheidt (b.v. BAMBE, MRBAYES) is het gebruik van vijf-statige sequentie-evolutie-modellen als middel om de GAP-informatie op te nemen bij het schatten van een uitlijning. Ondanks de viling van deze modellen in de literatuur in het verleden (bijvoorbeeld Durbin et al., 1998, blz. 217), is gebleken dat ze in veel omstandigheden nuttig zijn voor het verbeteren van de precisie van de topologieschatting.

Mac5 Gerelateerde software