3DICSI

Analyse CSI-gegevens snel en eenvoudig.
Download nu

3DICSI Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • Qi Zhao
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 3.3 MB

3DICSI Tags


3DICSI Beschrijving

3DiCSI is een kleine, eenvoudige, makkelijk te gebruiken applicatie ontwikkeld om u te helpen Chemical Shift Imaging (CSI) gegevens te interpreteren. Het combineert data visualisatie, spectrale verwerking, spectrale lokalisatie en de schatting, spectrale kwantificering samen met multivariate analytische procedures, bijvoorbeeld Principal Component Analysis (PCA) en beperkt niet-negatieve matrixfactorisatie (cNMF). Vooral cNMF een efficiënte manier om onderliggende spectrale patronen die fysiek betekenisvol zijn herstellen. Belangrijkste kenmerken: gegevensinvoer en Visualisatie: Automatische invoer van 1D / 2D / 3D CSI ruwe data van Philips, GE, Siemens en Bruker scanners. Elk bekend datatype kan worden ingevoerd door handmatig parameters. Eventuele extra formaten worden ook ondersteund door middel van derden plug-ins. CSI databank anatomische referentiebeelden worden geregistreerd en weergegeven in hetzelfde venster. Elk voxel wordt in een apart venster, de ruimtelijke locatie duidelijk zichtbaar in de drie orthogonale beeldvensters. 3D beeld reconstructie van beelden in één richting. Multi-dimensionale Spectral Data Processing: Constante fase en lineaire fasecorrectie. temporele filtering (Lorentz, Gaussian of gecombineerd). Ruimtelijke egalisatie (Hamming, Cosinus Fermi). Correctie van de basislijn. Water onderdrukking. aanpassing PPM vertrek en nul vullen. Lipide Suppression. Extra uitlijning. Batch-verwerking: Sequentie van verwerkingsstappen kunnen worden opgenomen in een macrobestand en aan de CSI gegevensset. Dezelfde macrobestand kan worden toegepast op een reeks onderzoeken ladingsgewijs. Spectrale Lokatie: Realtime-muis vergemakkelijkt interactieve voxel verschuiving in de 3 dimensies. middeling van meerdere geselecteerde voxels. Spectral schatting van een getrokken 2D / 3D-regio van belang gebruiker. Multivariant spectraalanalyse: Principal Component Analysis (PCA) voor de gebruiker gedefinieerde spectraalgebied en ROI, Principal Components (PC) identificeren de variatie bronnen in het CSI dataset. -PCA gebaseerde iteratieve piek align procedure frequentie- en fasevariaties verwijderen. Beperkt niet-negatieve matrixfactorizatie (cNMF) gebruikt om spectrale patronen en hun ruimtelijke verdelingen die fysiek betekenisvol zijn vorderen. Spectrale Kwantificering: Metabole kaart genereren met behulp van oppervlakte-integratie en PCA. Kaart genereren voor piekverhouding en de gebruiker gedefinieerde gebieden. Absolute kwantificatie van metabolietconcentratie gebruik referentiespectrum. kaartweergave schaalaanpassing vergelijking tussen verschillende sets schakelen. Spectral integratie gebruiker bestuurde basislijncorrectie. Gegevens Output: Diverse resultaat output opties, zoals HTML-formaat rapport, CSI slice en imago uit te printen, weer te kopiëren en plakken functies, spectraal ascii / binaire uitvoer, metabole afbeelding uitvoer. Programma uitbreidbaarheid: Plug-mechanisme ter ondersteuning CSI data invoer module ontwikkeld door derden.


3DICSI Gerelateerde software