Bowtie voor Linux

Bowtie voor Linux is een ultrapast, geheugenzuinige korte leesigner
Download nu

Bowtie voor Linux Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • Ben Langmead
  • Uitgever website:
  • Besturingssystemen:
  • Linux
  • Bestandsgrootte:
  • 13.40MB

Bowtie voor Linux Tags


Bowtie voor Linux Beschrijving

Advertentie Bowtie voor Linux is een woning- en onderwijssoftware ontwikkeld door Ben Langmead. Na onze rechtszaak en test, wordt de software bewezen officieel, veilig en gratis te zijn. Hier is de officiële beschrijving voor Bowtie voor Linux: Bewerken door Bowtie voor Linux is een ultrapast, geheugenzuinige korte leesigner. Het lijnt korte DNA-sequenties (leest) uit op het menselijke genoom met een snelheid van 25 miljoen, leest per uur op een typisch werkstation met 2 gigabytes van het geheugen. Bowtie-indexeert het genoom met een index van Burrows-Wheeler om zijn geheugenvoetafdruk klein te houden: 1,3 GB voor het menselijk genoom. Het ondersteunt het uitlijnbeleid gelijk aan MAQ en zeep, maar is veel sneller: ongeveer 35x sneller dan MAQ en meer dan 350x sneller dan zeep bij het uitlijnen van het menselijk genoom. Functies: Vaste alle bekende problemen opgelost met de - Unfa / - UFQ-opties: Ze werken nu goed met meerdere draden. Vaste kwestie waarbij sequentie en kalen soms worden omgekeerd. Gefixeerde andere kwesties die onechte weglating van niet-gealigneerde lezingen veroorzaken. Toegevoegd - MaxFA / - MAXFQ-opties, zodat leest die niet uitgelijnd is als gevolg van de -m-limiet afzonderlijk kan worden gedumpt van lees die helemaal niet uitkomen. Uitlijning Uitgang is nu gegarandeerd "deterministisch", zelfs wanneer meerdere draden worden gebruikt. D.w.z. gezien dezelfde ingang luidt (in willekeurige volgorde) en dezelfde - zaad, zal Bowtie dezelfde uitlijning produceren elke keer dat het wordt uitgevoerd, maar niet noodzakelijk in dezelfde volgorde. Dit houdt niet in verschillende versies van Bowtie. Meerdere andere bugfixes.


Bowtie voor Linux Gerelateerde software

Over ons