CMView Contact kaartvisualisatie gemaakt gemakkelijk.
Download nu

CMView Rangschikking & Samenvatting

CMView Tags

visualisatie visie kaart visualiseren visualizer kaart visualizer Kaart Analyzer BERICHTJE STUREN Kaartvisualisatie analyseer de contactkaart BERICHTJE STUREN Kaartviewer genoom kaartvisualisatie Windows Vista vol Wallpaper Aquarium 3D www.java.com alleen freeware video MP3-danser Nieuw budget travel wallpaper zus omzetten naar vcd audio ripper AV Sync Caculator java tijdstempel generator schepper van de wereldvlag TWAIN COMMANDER 2.0

CMView Beschrijving

CMView is handig, eenvoudig te gebruiken, op Java gebaseerde, interactieve contactkaart visualisatie en analyse-toepassing. CMView is een softwaretool voor het visualiseren en analyseren van het netwerk van contacten tussen aminozuurresiduen in een eiwitstructuur. Formeel is dit netwerk een grafiek waarbij elk residu overeenkomt met een knooppunt en twee knooppunten zijn verbonden door een rand als en alleen als de twee residuen in contact zijn. Twee residuen worden beschouwd als in contact als ze ruimtelijk dichtbij zijn in de driedimensionale structuur. In CMView wordt de definitie van contact bepaald door twee paremeters: het contacttype en de afstandsnede. Het contacttype definieert een subset van atomen van het residu. Twee residuen I en J zijn dan in contact als twee atomen uit deze subset zijn, een van I en een van J, niet verder uit elkaar liggen dan de afstandsnede. De weergave van het contactnetwerk als matrix (formeel, de aangrenzende matrix van de contactgrafiek) wordt een contactkaart genoemd. Belangrijkste kenmerken: Gecombineerde contactkaart en 3D-structuurweergave (met behulp van pymol) Verschillende IM- en Exportopties: PDB-bestanden, online PDB, afbeelding Export, CAP voorspellingsindeling en anderen Berekening van contactkaarten met door de gebruiker gedefinieerde contactdefinities -tegratie met pymol voor feature-rijke 3D-moleculaire visualisatie -structuur en contactkaartvergeling met ingebouwde sequentie of structurele uitlijningen Afstandskaart, verschilkaart, contactdichtheidsanalyse

CMView Gerelateerde software