Convergeren Convergente en parallelle evolutie in het niveau van het aminozuursequentie
Download nu

Convergeren Rangschikking & Samenvatting

Convergeren Tags

volgorde zuur zuur lettertype Zure transactie vind aminozuur aminozuurzoeker aminozuur zoeken Aminozuuranalysator Aminozuursequentie aminozuur aminozuur vertaler zuur thema Extract-aminozuur zuuroplossing aminozuurresidu optimaal aminozuur nucleïnezuursequentie Analyse aminozuur Nucleïnezuur analyseer het aminozuurpaar aminozuren paar analyse Aminozuursequentie-analyse analyseer aminozuursequentie aminozuurclassificatie Aminozuur topologie Convergente evolutie Parallelle evolutie Convergerend Amino-zure detector detecteren aminozuur Sequentie-evolutie DNA Sequence Evolution analyseren aminozuurketen Zure transacties zure pro ACID PRO 7

Convergeren Beschrijving

Deze aanvraag is ontwikkeld om convergerende en parallelle evolutie te testen in het niveau van het aminozuursequentie. Het berekent de kansen die de waargenomen convergente en parallelle substituties toe te schrijven zijn aan willekeurige kans. Dit pakket bevat één programma: converg2.exe, dat is geschreven in C-taal. Om het programma te gebruiken, hebt u een invoerbestand nodig dat de aminozuursequenties en de boomtopologie van deze sequenties bevat (zie Lysozyme.AA voor een voorbeeld). Dit bestand begint met twee nummers: het aantal sequenties en het aantal aminozuursites (volglengte). De tweede regel is de naam van de eerste reeks en de derde regel is de eerste reeks, enzovoort. Alleen het ene lettercode (geactiveerd) voor de 20 aminozuren zijn toegestaan in de reeksen. De sequenties moeten worden uitgelijnd en hiaten of andere symbolen worden al verwijderd. De laatste regel van het bestand is de boomtopologie van de sequenties. Het boomformaat is hetzelfde als die wordt gebruikt in Phylip-pakket (Felsenstein 1995). Merk op dat de boom niet-ontgroeftig is, dus de trap in plaats van is vereist voor het diepste vertakkingsknooppunt.

Convergeren Gerelateerde software