Cytosed Beheer uw metabole modellen met behulp van deze tool
Download nu

Cytosed Rangschikking & Samenvatting

Cytosed Tags

inpluggen kijker manipulator Cytoscape Plugin

Cytosed Beschrijving

Cytosed werd gebouwd als een Cytoscape-plug-in die u kan helpen bekijken, manipuleren en analyseren van metabole modellen gemaakt met het modelzaad. De cytosebed plug-in is ontworpen om gebruikers van het modelzaad in staat te stellen informatieve visualisaties te creëren van de reactienetwerken die zijn gegenereerd voor hun interesse organismen. Gebruikers kunnen elk model laden waarvoor ze toegang hebben in het modelzaad. De Cytosed-plug-in downloadt de modelgegevens, reacties en verbindingen van het modelzaad en organiseert de reacties in netwerken op basis van hun bijbehorende KNGG-kaarten. Na de initiële belasting (die enkele minuten kan duren), worden de modelgegevens opgeslagen op het bureaublad van de gebruiker in een opgegeven map voor snelle laden in volgende sessies. Belangrijkste kenmerken: Modellen downloaden van het modelzaad; Creëren van cytoscape-sessies voor het bekijken van modellen; Besparen en heropening Cytoscape-sessies creatie en verwijdering van route kaarten; Reacties verplaatsen / kopiëren tussen padway-kaarten; Knooppunten verbergen / tonen binnen Pathway Maps visualisatie van de analyse van fluxvariabiliteit resulteert in meerdere media; Reacties zijn gekleurd op basis van essentiële / actieve / inactieve / GAP-gevulde categorieën Mogelijkheid om modellen te openen voor meerdere organismen in één cytoscape-sessie, om vergelijkende modelanalyse in te schakelen visualisatie van Flux Balance Analysis Resultaten

Cytosed Gerelateerde software