Famd analyseer DNA-sequenties met deze tool.
Download nu

Famd Rangschikking & Samenvatting

Famd Tags

analys analyse Analyseren dna hulpmiddel Analyse DNA DNA-schermbeveiliging DNA-visualisatie DNA-analyseren Analyse DNA-gegevensset DNA beheren Analyse DNA Micro Array DNA-gegevens analyseren Analyseer biologische sequenties DNA-sequenties bewerken DNA Sequences Editor Principal Coordinate Analyse DNA-sequentiesanalyse analyse DNA-sequenties Analyse DNA-uitlijning uitgelijnde DNA-sequenties DNA-sequenties Analyseer moleculaire sequenties mitochondriaal DNA analyseren analyseer DNA-methyleringsgegevens analyseren polypeptidesequenties metagenomische sequenties analyseren RNA-sequenties analyseren analyseer RNA-sequenties analyseer DNA-beperking opeenvolgingen

Famd Beschrijving

DNA Fingerprinting (AFLP, RAPD, ISSRS, enz.) Studies zullen inherent onzekerheden met zich mee nemen, of dat geluid is aan de techniek, of fouten die bij het scoren zijn gemaakt, enz. U kunt uw gegevens scoren met afwezigheid / aanwezigheid (0/1). Dit betekent dat u probeert om gegevenspunten te scheiden waarvan u niet zeker bent in afwezigheid en presenties (om conservatief te zijn, waarschijnlijk afwezigheden in plaats van presenties). Als alternatief kunt u onzekerheden toestaan: (0 /? / 1). Hiermee kunt u later een tweede keer naar uw gegevens bekijken en vragen welke impact deze ambigue of ontbrekende gegevens kunnen hebben op uw analyse. Famd is een beetje, eenvoudig te gebruiken applicatie speciaal ontworpen om je te helpen dat te doen. Specifiek het aanpakken van ontbrekende (of dubbelzinnige) gegevens, implementeert FAMD het volgende: · Minimale / maximum / gemiddelde (DIS) Vergelijkingsberekening waardoor de schatting van de mate waarin ontbrekende gegevens van invloed kunnen zijn op de analyse. · Jaccard's, dobbelstenen, SMC-overeenkomsten, Neili en Euclidische afstanden · Output van afstandsmatrices · Ontbrekende gegevensopvatting · Schatting van de index van Shannon door Bootstrapping. · Upgma, NJ, strikte en meerderheidsregel consensusbomen · Schatting van R-support · PCOA (hoofdcoördinatenanalyse) en 3D-viewer met bitmap en metafile ondersteuning · AMOVA voor alle geïmplementeerde (dis) overeenkomsten · Export van gegevens naar een aantal indelingen zoals Nexus, Arlequin Project, Hindex, Hickory (Nexus Allelles Block), Genepop, NTSYSPC, Structuur, Hindex. · Bayesiaanse schatting van de allelrefrequentie en berekening van inter-bevolkingsafstanden.

Famd Gerelateerde software