Fastml Een programma voor het berekenen van de voorouderlijke aminozuursequenties van een fylogenetische boom
Download nu

Fastml Rangschikking & Samenvatting

Fastml Tags

volgorde zuur Phylogenetische boomviewer bekijk de fylogenetische boom Phylogenetische boomsequentie vind aminozuur aminozuurzoeker aminozuur zoeken Aminozuuranalysator Aminozuursequentie aminozuur aminozuur vertaler schat fylogenetische boom fylogenetische boom Analyseer de fylogenetische boom Extract-aminozuur fylogenetisch aminozuurresidu optimaal aminozuur Ancestral Gene Cluster Ancestral Gene fylogenetische boomeditor maak fylogenetische boom Phylogenetische boomgenerator bewerk de fylogenetische boom bouwen van fylogenetische boom Phylogenetische tree-schatting Analyse aminozuur Nucleïnezuur analyseer het aminozuurpaar aminozuren paar analyse Phylogenetische boomanalysator display fylogenetische boom Aminozuursequentie-analyse analyseer aminozuursequentie Geannoteerde fylogenetische boom aminozuurclassificatie Aminozuur topologie Herken sequentie Amino-zure detector detecteren aminozuur analyseren aminozuurketen voorouderlijke

Fastml Beschrijving

FastML is ontwikkeld om een programma te zijn voor het berekenen van de voorouderlijke aminozuursequenties van een fylogenetische boom. Gebruik: FastML gebruikt vlaggen in de opdrachtregelargumenten: - voor hulp, typ "fastml.exe -h" -S SEQ.Ann = de volgbestandsnaam van de reeks invoer. -t tree.txt = de invoerboombestandsnaam (Newick-formaat). Het programma herkent automatisch een van deze sequentie-indelingen: Phylip, molphy, Fasta, Mase, Clustal of Nexus. Gebruik de optie -M om een model te kiezen. De volgende modellen worden ondersteund (voor aminozuren): Dag, JTT, Rev, CPRev, WAG, JC. Voor nucleotiden wordt momenteel alleen het JC-model ondersteund. Het standaardmodel is de JTT.

Fastml Gerelateerde software