| Fragmentationanalyzer Een stand-alone Java-tool om MS / MS-fragmentatiegegevens te analyseren |
Download nu |
Fragmentationanalyzer Rangschikking & Samenvatting
- Vergunning:
- Apache License 2.0
- Naam uitgever:
- Harald Barsnes, Lennart Martens
- Besturingssystemen:
- Windows All
Fragmentationanalyzer Tags
Fragmentationanalyzer Beschrijving
Fragmentation Analyzer is een op java gebaseerd open source-instrument dat kan worden gebruikt om MS / MS-fragmentatiegegevens te analyseren. Negen verschillende analysetypen worden ondersteund: · Spectra-visualisatie - visualiseer de MS / MS-spectra met fragmentionannotatie, zoomen en handmatige de-novo-sequencing. · Intensiteitsdoos Percelen - Analyseer intensiteitsvariatie voor een reeks identificatie van hetzelfde peptide. · Intensiteitscorrelatie - detecteren hoe de intensiteit correleert met de verspreiding in intensiteit. · Intensiteit Meta-plots - analyseer verder de variaties in intensiteit. · Massa-fout scatter-plots - visualiseer de massa-fout, verspreid in een reeks geselecteerde identificaties / spectra. · Massa-fout bubble plots - hetzelfde als massa-foutverstrooit plots, maar met piekintensiteiten toegevoegd. · Massistress Box-plot - analyseer de variatie in massa-fouten. · Fragment ion-waarschijnlijkheidsplot - analyseer de kans op het observeren van specifieke fragmentionen ionen. · Fragment ion warmtekaart - Vergelijk fragmentatie met behulp van warmte kaarten van correlatiegegevens. Belangrijkste kenmerken: ondersteunt drie invoerformaten: MS_LIMS 7 Mascotte DAT-bestanden OMSSA OMX-bestanden
Fragmentationanalyzer Gerelateerde software