GA Fuzzy Clustering

Een clusteringstool voor microarray-gegevens
Download nu

GA Fuzzy Clustering Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • BioRainbow Group
  • Bestandsgrootte:
  • 444 KB

GA Fuzzy Clustering Tags


GA Fuzzy Clustering Beschrijving

De GA Fuzzy Clustering-applicatie is ontwikkeld om een programma te zijn dat combinatie van genetisch algoritme en C-middelen wordt gebruikt voor het clusteren van microarray-gegevens en afstandsmatrixgegevens. Invoerbestandsformaat :: - Dit programma maakt gebruik van een vlak tekstbestand als invoer. - Alle gegevensitems moeten worden gescheiden door tabulators. - Geen ontbrekende waarden zijn toegestaan. Microarray: - Eerste regel bevat namen van alle kolommen. - Elke regel (begin met de tweede) moet de gennaam (1 kolom of meer) en de expressiewaarden voor elke toestand hebben. Afstand matrix: - Eerste regel bevat bijschrift (enkel woord of een tekenreeks in de 1e positie) en namen van elementen - Elke regel (begin met de tweede) moet de naam van het element (hetzelfde, zoals in de overeenkomstige kolom) en waarden van afstanden tussen dit element en de anderen bevatten. - Matrix is symmetrisch. - Alle waarden worden genormaliseerd (niet groter dan 1,0). - Opmerking: gelijkmatigheidsmatrix is ook toegestaan. Uitvoerbestandsformaat: - Parameters van het algoritme - Verdeling van genen in clusters (als lidmaatschap> 1 / Nuberofclusters) is) - lidmaatschapsmatrix voor alle genen - coördinaten van centra van clusters (in de genexpressie-eenheden)


GA Fuzzy Clustering Gerelateerde software

Dnap

Softwarepakket voor de analyse van nucleotide polymorfisme. ...

178 Free

Downloaden