Gpmaw is voornamelijk bedoeld als een hulpmiddel voor massaspectrometrische analyse van eiwitten.
Download nu

Gpmaw Rangschikking & Samenvatting

Gpmaw Tags

Gpmaw Beschrijving

Het GPMAW-programma is primair bedoeld als een hulpmiddel voor massaspectrometrische analyse van eiwitten en peptiden. Er is echter een aantal andere bio-informatica-tools opgenomen, dus het gebruik van het programma strekt zich veel verder dan eenvoudige massalyse. Belangrijkste kenmerken: - Volgordeafhandeling: import van sequenties van een aantal verschillende indelingen met directe database-zoekopdracht in Entrez en in lokale databases (FASTA-formaat en Swiss-Prot). Sequenties kunnen worden opgeslagen in lokale bestanden (databases) voor toekomstig gebruik. Vanuit het reeksvenster kan een groot aantal acties worden uitgevoerd. Sequenties kunnen in Fasta-indeling (afzonderlijke of alle sequenties tegelijk) worden geëxporteerd) voor eenvoudige overdracht naar andere programma's. - Massalyse: het eiwit kan worden gesplitst door automatische werkwijzen (bijvoorbeeld een flexibele nomenclatuur voor het definiëren van enzymacties) of handmatig. De peptiden worden weergegeven met een aantal parameters (verschillende massawaarden - MONO, AVE, kosten - Bullbreese index, HPLC-index, PI, lading) en kan verder worden gewerkt aan (bijvoorbeeld verknoopte, nieuwe splitsing). Peptide Mass-zoekopdrachten kunnen worden uitgevoerd op een lokale database in FASTA-indeling. - Bio-informatica: een aantal grafieken kunnen worden weergegeven, hydrofobiciteit, dot-perceel, voorspelling secundaire structuur. Blast-zoekopdrachten kunnen worden uitgevoerd op lokale databases. Meerdere uitlijning met behulp van Clustalw.

Gpmaw Gerelateerde software