Metasim Genereer synthetische leest-collecties met deze applicatie.
Download nu

Metasim Rangschikking & Samenvatting

Metasim Tags

Analyseren genereren Ondersteuning voor synthetische apparaten Synthetische netwerkcontroller Synthetisch synthetische koor Synthetische golfvorm Synthetische soundscape Synthetisch biologisch systeem synthetische spraak Metagenome dataset synthetische leest collectie creëren synthetische ontologieën synthetische ontologieëngenerator Genereer synthetische ontologieën

Metasim Beschrijving

Metasim is een handig hulpmiddel dat speciaal is ontworpen om u te helpen bij het genereren van collecties synthetische lezingen die de uiteenlopende taxonomische samenstelling van typische metagenoomdatasets weerspiegelen. Op basis van een database met gegeven genomen, kan het programma de gebruiker een metagenoom ontwerpen door het aantal aanwezige genomen op verschillende niveaus van de NCBI-taxonomie op te geven en vervolgens leestingen van het metagenoom te verzamelen met behulp van een simulatie van een aantal verschillende sequentietechnologieën . Een populatie-sampler produceert optioneel geëvolueerde sequenties op basis van brongenomen en een bepaalde evolutionaire boom. De resulterende gegevenssets kunnen worden gebruikt als gestandaardiseerde testscenario's voor het plannen van projecten of voor benchmarking assembler en metagenomische software. Belangrijkste kenmerken: Integreert een database voor Source Genome Sequences genereert sets synthetische lezingen of Mate-paren op basis van aanpasbare sequencing-foutmodellen (bijvoorbeeld voor Sanger Chemistry, Roche's 454 en Illumina (voormalig Solexa) stelt de gebruiker in staat overvloedwaarden voor elk organisme te configureren om specifieke taxonsamenstellingen te modelleren biedt een populatie-sampler om geëvolueerde sequenties te genereren op basis van brongenomen en een bepaalde evolutionaire boom kan worden gecontroleerd via grafische gebruikersinterface of in de opdrachtregelmodus

Metasim Gerelateerde software