Modelleertest Een gereedschap om het best-fit model van nucleotide-substitutie te selecteren
Download nu

Modelleertest Rangschikking & Samenvatting

Modelleertest Tags

URL-vervanging selectie tekstvervanging vervanging nucleotidevenredance Trichview substitutie vervanging Cipher Shift-Substitution Ciphers nucleotidesequentie nucleotidesequentiemanager nucleotide gedeeltelijke vervanging staatsvervanging monoalfabetische substitutie Nucleotide-substitutiemodel nucleotide motief complexe substitutiemodel Substitutie van nucleotide Model selectiekader hiërarchische waarschijnlijkheid Nucleotide-annotatie DNA Substitutiemodel Nucleotide-uitlijning Substitution DNA-model Synonieme substitutie Nonsynonische substitutie substitutiemodel nucleotide polymorfismen Nucleotide-mutatie nucleotide fractie

Modelleertest Beschrijving

Modeltest is een geavanceerd en betrouwbaar stuk software ontwikkeld om genetica-ingenieurs te dienen bij het bepalen van de verschillen tussen DNA-substitutiemodellen met behulp van hiërarchische hypothese-tests om de resultaten te genereren. Opdrachtregelinterface De applicatie is vrij complex, omdat het bedoeld is voor ervaren gebruikers met een solide achtergrondkennis in genetica en computers, met name omdat het geen GUI biedt, alleen door de opdrachtregelinterface, die het redelijk uitdagend kan maken, voor beginners. Niettemin vereist Modeltest geen installatie, dus het volstaat voor gebruikers om het uitvoerbare bestand gewoon op een openen van de opdrachtprompt te laten vallen en op de ENTER-toets te drukken, die op zijn beurt de functies van het programma samen met een korte uitleg van de beschikbare opdrachten zal onthullen. Functies en lopende parameters Modeltest is bedoeld om te werken met bestanden die zijn gegenereerd door PAUP * die de vereiste genetica-informatie bevatten, evenals bestanden die RAW-logboekcores bevatten samen met parameterramingen voor de beoordeelde modellen. Aan de andere kant genereert het hulpprogramma een beschrijving van de waarschijnlijkheidsratio-tests die werden uitgevoerd, en hun overeenkomstige P-waarden, informatie die vervolgens wordt geïnterpreteerd en een goed model toegewezen. De ondersteunde modellen staan vermeld in de opdrachtregelinterface, inclusief JC (JUKES en CANTOR), TRNEF (TAMURA-NEI met gelijke basisfrequenties), TIM (Transitional Model), GTR (Algemene Tijd reversible), F81 (Felsenstein) en nog meer . Tegelijkertijd kunnen gebruikers werken met een specifieke reeks functies, geïllustreerd in het hoofdvenster om ze gemakkelijker te begrijpen en te gebruiken. Als zodanig kunnen gebruikers het debug-niveau (-d), het alfa-niveau (-A), het aantal taxa (-t), de LRT-calculator-modus (-L) activeert, bepaalt het betrouwbaarheidsinterval voor gemiddeld (-W) of gebruik bic in plaats van AIC voor alle toekomstige operaties (-b). Een uitgebreid instrument voor het bepalen van het juiste substitutiemodel Tot slot, Modeltest is een efficiënte toepassing die is ontwikkeld voor professionals die op het gebied van genetica werken, waardoor ze het middel om DNA-substitutiemodellen te vergelijken, waardoor gebruikers het beste bij hun gegevens passen.

Modelleertest Gerelateerde software