Multigeneblast Identificeer homoloog van multi-genmodules zoals operons en genclusters.
Download nu

Multigeneblast Rangschikking & Samenvatting

Multigeneblast Tags

identificeren gen

Multigeneblast Beschrijving

MultigenenBlast is een open source-tool op basis van een herformaat van de FASTA-headers van NCBI Genbank-eiwitboekingen, met behulp van hetgeen het kan hun bronnucleotide en coördinaten opsporen. MultigenenBlast kan helpen bij de detectie van dergelijke multigene-onderdelen voor synthetische biologieprojecten. Een synthetische bibliotheek van de operons kan worden gemaakt op basis van de uitvoer om die operons te identificeren waarvan de functie het dichtst bij de gewenste door de gebruiker ligt. Deze tool biedt de mogelijkheden om alle homologe genomische regio's te identificeren door de resultaten van Single Blastp-runs op elk gen te combineren en genomische regio's uit elk genbank-inzending te sorteren door het aantal hits, Synteny Conservation en Cumulative Blast Bit Score. Architectuurzoekopdrachten kunnen worden uitgevoerd om genomische gebieden te vinden met Blast-hits op elke door de gebruiker gespecificeerde combinatie van aminozuursequenties.

Multigeneblast Gerelateerde software