Nemo

Studeer de geschiedenis van fenotypische sets
Download nu

Nemo Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • GPL
  • Naam uitgever:
  • Siddhartha Jonnalagadda
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 3.5 MB

Nemo Tags


Nemo Beschrijving

NEMO is een voorwaartse tijd, genetisch expliciete, individuele en stochastische simulatie-software die speciaal is gebouwd om de evolutie van levensgeschiedenis / fenotypische eigenschappen en bevolkingsgenetica te bestuderen in een flexibel (meta-) bevolkingskader. NEMO implementeert veel verschillende levenscyclusevenementen en evolueerbare eigenschappen met een verscheidenheid aan genetische architecturen. Species-interactie tussen een parasiet en de gastheer kan ook worden gemodelleerd (d.w.z. cytoplasmatisch-incompatibiliteit inducerend endosymbiont: Wolbachia). Dit alles is ingelijst binnen een flexibel metapoppelmodel dat patch-specifieke draagcapaciteiten, dispersale tarieven, stochastische uitsterven / oogstkoersen en demografische stochasticiteit mogelijk maakt. Populaties kunnen tijdens een simulatie dynamisch worden gewijzigd, waardoor bottlenecks, Patch Fusion / Fisson, Population Expansion, enz., Ruimtelijk heterogene selectie op kwantitatieve kenmerken kan worden gemodelleerd. Belangrijkste kenmerken: -eigenschappen: Neutrale markeringen (Microsatellites, SNPS) Deleterieuze mutaties (met locus-specifieke vaste of willekeurige effecten en dominantie) kwantitatieve kenmerken (nieuw in v2.2.0) (met pleiotrope kwantitatieve loci) Dispersal (mannelijke en vrouwelijke specifieke uitdrukking) Wolbachia (Maternally-geërfd cytoplasmatisch-incompatibiliteit inducerend endosymbiont) Levenscyclus Evenementen: fokkerij (met promiscuïteit, polygyny, monogamie, selfing en klonerende paringsystemen) Dispers (migranten pool / propagule pooleiland model, 1D en 2D roostermodellen, enz.) ouder worden (met plafond patchregulatie) levensvatbaarheid (op basis van schadelijke mutaties of stabiliserende selectie op kwantitatieve kenmerken) uitsterven / oogsten Patch Fusion / Fission Crossing Design (Full-Sib / Half-Sib Designs)


Nemo Gerelateerde software

Hist3d

Een Java-programma om een 2D-reeks van waarden als een oppervlak te plotten ...

196 192 KB

Downloaden