Prodge

Onderzoeken van eiwit-eiwitinteracties op het domeinniveau
Download nu

Prodge Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • University of Tübingen
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 10.4 MB

Prodge Tags


Prodge Beschrijving

Prodge (Protein Domain Gene) visualiseert bestaande en suggereert nieuw domein - Domeininteracties en eiwit-eiwit-interacties op het domeinniveau. De uitgebreide dataset achter Prodge bestaat uit eiwitten, domein en interactiegegevens voor beide lagen, verzameld en gecombineerd op gepaste wijze van Uniprot, PFAM, domine en intact. Op basis van bekende domeininteracties, suggereert Prodge nieuwe eiwitinteracties en wijst ze toe aan vier vertrouwensklassen, afhankelijk van de betrouwbaarheid van de onderliggende domeininteractie. Bovendien kan Prodge potentiële homologe interactie-partners in andere soorten identificeren, wat bijzonder nuttig is bij het onderzoeken van slecht geannoteerde soorten. Krijg Prodge en probeer het eens te zien waar het allemaal om draait!


Prodge Gerelateerde software