Quasirecomb Genereer en analyseer virale quasispecies die aan recombinatie worden onderworpen.
Download nu

Quasirecomb Rangschikking & Samenvatting

Quasirecomb Tags

gevolgtrekking Recombinatie

Quasirecomb Beschrijving

Quasirecomb is een lichtgewicht applicatie die in de opdrachtconsole draait, een Markov-model simuleert voor het genereren van virale quasispecies. Het beschrijft de generatie van de virale quasispecies en een methode om de parameters af te leiden door de volgende generatie sequentiegegevens te analyseren. Het model is gevalideerd op gesimuleerde gegevens, wat het voordeel toont om het recombinatieproces expliciet in aanmerking te nemen, en getest door toepassing op lezingen die zijn verkregen van experimentele HIV-monsters. Het biedt een implementatie van het EM-algoritme om maximale schattingen van de posteriori te vinden van de modelparameters en een methode om de verdeling van virale stammen in de quasispecies te schatten.

Quasirecomb Gerelateerde software