STANG Soorten Tree-schatting met behulp van maximale waarschijnlijkheid
Download nu

STANG Rangschikking & Samenvatting

STANG Tags

analyse Kostenraming schatting schatting Time Motion Schatting maximum CFF3-schatting soorten gen vogelsoorten software schatting parameterschatting Dispariteitsschatting Cetacea soorten Creëer soorten Genereer soorten FDR-schatting HAPLOTYPE-schatting soort boom Soorten monitor Prestatieraming Schattingsscherm Osmose-schatting hiërarchische waarschijnlijkheid Phylogenetische tree-schatting modelparameters schatting grote fylogeny-schatting grote fylogenies-schatting Taklengte gen tree schatting maximum likelihood allel kanaalschatting Inspanningsraming Afdrukschatting Maximale linkdepth

STANG Beschrijving

Stem is ontwikkeld om een programma te zijn voor het afleiden van maximale waarschijnlijkheidsspecies van een verzameling van geschatte genbomen onder het coalescentiemodel. Het programma zal de exacte ML-boom retourneren, de waarschijnlijkheid berekenen voor een door de gebruiker gespecificeerde boom, of zoekt een reeks hoogste waarschijnlijkheidsbomen. De methode voor het zoeken van de ruimte van bomen is een gesimuleerd uitgloeidalgoritme. Stem vereist verschillende invoerbestanden. De eerste hiervan is het bestand dat de informatie geeft Voor de genbomen, die genetrees.tre worden genoemd. Dit bestand bevat de genbomen met taklengtes in Newick-formaat. Gene-bomen moeten worden geworteld en moeten voldoen aan de moleculaire klok, hoewel het programma dit niet zal controleren (u zult waarschijnlijk een foutmelding krijgen of deze wordt ingesteld als dit niet het geval is). Direct voor elke gen-boom is een getal binnen vierkante haakjes die de koersvermenigvuldiger voor elk gen geven.

STANG Gerelateerde software