SVM-techniek voor het evalueren van proteotypische peptiden Stepp is een evaluatie van proteotypische peptides-tools.
Download nu

SVM-techniek voor het evalueren van proteotypische peptiden Rangschikking & Samenvatting

SVM-techniek voor het evalueren van proteotypische peptiden Tags

password Breaker Gitaartechniek Gratis mobiele telefoon TV-software voor Mobiele antivirussoftware LIX.IN FORUM LS LG GT540 Optimus Voorspelling SVM SVR Release-techniek DELPHI TECHNIEK PROJECT RFP evalueren tekeningstechniek gratis vox s

SVM-techniek voor het evalueren van proteotypische peptiden Beschrijving

De Stepp Software bevat een implementatie van een getrainde SVM (ondersteuningsvector machine) die een score kan berekenen die vertegenwoordigt hoe "proteotypisch" een peptide door LC-MS is. Het programma kan een eiwitbestand lezen, een in-silico-digestie uitvoeren en de waarnemingscore berekenen voor elk tryptisch of gedeeltelijk tryptisch peptide. Merk op dat grotere (positieve) scores betekenen dat een peptide wordt voorspeld dat ze meer proteotypisch zijn, terwijl lagere (negatieve) scores betekenen dat het peptide niet wordt voorspeld als proteotypisch. Het SVM-model dat wordt gebruikt door StepP is een eenvoudige descriptorruimte op basis van 35 eigenschappen van aminozuurgehalte, lading, hydrofiliciteit en polariteit voor de kwantitatieve voorspelling van proteotypische peptiden. Het model werd getraind en gevalideerd met drie onafhankelijk afgeleide AMT-databases (Shewanella Oneidensis, Salmonella Typhimurium, Yersinia Pestis). De SVM resulteerde in een gemiddelde nauwkeurigheidsmaatregel van ~ 0,8 met een standaardafwijking van minder dan 0,025.

SVM-techniek voor het evalueren van proteotypische peptiden Gerelateerde software