Spindel Workbench Krijgen een methode voor soortidentificatie in alle domeinen van het leven met behulp van multiplex-analyse.
Download nu

Spindel Workbench Rangschikking & Samenvatting

Spindel Workbench Tags

analyse volgorde rekenprestaties Computationele efficiëntie beheer platform internet management platform Computational Geometry computationeel Computational Model Computational Finance Computational Component Computational Biolog Computational Astronomy computationele chemie nucleotidesequentie Computational Probleem Computational Power Computational Neurowetenschap Computational-aanpak Promationeel kunstwerk genereren Computationele intelligentie Azure Platform Management Projectenbeheer

Spindel Workbench Beschrijving

De Spindel is een alternatieve benadering voor biologische identificatie op basis van de lengte van ribosomale RNA (RRNA) -genregio's. In het algemeen tonen de afstemming van primaire RRNA-gensequenties uit verschillende soorten wisselende gebieden van nucleotide-instandhouding en variatie, zowel in termen van nucleotide-substituties (gewoonlijk "SNPS") en invoeging / verwijdering (Indel) evenementen. De aanwezigheid van Indels resulteert in sequenties van verschillende lengtes en introduceert hiaten in de uitlijning, meestal aangeduid met een dashboard "-". Ons concept voor biologische identificatie maakt gebruik van RRNA-gensequenties als volgt: geconserveerde regio's worden gebruikt om variabele segmenten ("spindel hypervariabele regio's") te definiëren waarin een combinatie van sequentielengtes kenmerkend zijn voor elke soort (een "spindelprofiel"). Elke soort kan dus worden gedefinieerd door een uniek numeriek profiel. In theorie is een overzicht van slechts 6 hypervariabele gebieden met 20 allelen (of 11 regio's met 5 allels elk) voldoende om alle eukaryote soorten op aarde te discrimineren, die naar schatting tussen 5 en 15 miljoen in aantal zijn. In de praktijk is Spindel in staat om 93,3% van de eukaryote soorten te discrimineren met een lage intraspecific variatie en een hoge fylogenetische resolutie.

Spindel Workbench Gerelateerde software