Squint uitlijning editor

Moleculaire uitlijngereedschap voor u om te gebruiken
Download nu

Squint uitlijning editor Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • The University of Auckland
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 1.9 MB

Squint uitlijning editor Tags


Squint uitlijning editor Beschrijving

Squint is een op Java gebaseerde, geavanceerde uitlijntool. Het programma is gemaakt om algorithmische uitlijning van moleculaire sequenties samen te brengen. De software is een uitbreiding van de uitlijneditor die beschikbaar is in Pebble. Belangrijkste kenmerken: Import / Exporteersequentie / uitlijningsgegevens in een aantal formaten (FASTA / NEXUS / CLUSTAL / PHYLIP). Bewerk de plaatsing van de gaten in een uitlijning, met de optie van twee weergaven van de gegevens die worden bewerkt (met één weergave die de gegevens toont als DNA, de andere als aminozuur bijvoorbeeld). dynamische feedback over het effect van wijzigingen in de uitlijning op een of meer maten van uitlijnscore. herstelt alle sequenties of slechts een geselecteerd gebied van de totale uitlijning. Voer uitlijnen uit op basis van een formaat dat anders is dan die van sequenties en hebben de resultaten in kaart gebracht naar de oorspronkelijke gegevens. Lijn bijvoorbeeld een nucleotidesequentie uit door aminozuur of codon.


Squint uitlijning editor Gerelateerde software