Treesnatcher Plus

Een fylogenetische boom vastleggen van tool
Download nu

Treesnatcher Plus Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • GPL
  • Naam uitgever:
  • Arndt von Haeseler
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 2.2 MB

Treesnatcher Plus Tags


Treesnatcher Plus Beschrijving

Treesnatcher Plus is ontwikkeld om een GUI-aangedreven Java-applicatie te zijn die het genereren van een machinele leesbare weergave van meerbarige fylogenetische bomen in pixelafbeeldingen automatiseert. Het maakt gebruik van beeldverwerkingsmethoden om het beeld voor te bereiden en de boomstructuur te detecteren. De gebruiker houdt toezicht op het semi-automatische herkenningsproces en maakt correcties aan de afbeelding en waar nodig de topologie. Aan het einde produceert het programma een Newick-boomcode die de boomstructuur optioneel vertegenwoordigt, inclusief taklengtes. Treesnatcher Plus is een uitgebreide en opnieuw geconceptualiseerde versie van Treesnatcher. Het is goed gemonteerd om het onderzoek op complexe fylogenies te ondersteunen en nuttig te zijn als men fylogenies wil combineren op basis van een verzameling reeds gepubliceerde bomen die niet elektronisch beschikbaar zijn. Bovendien is Bomennatcher Plus ook geschikt voor educatieve doeleinden, omdat de gebruiker zijn eigen bomen kan construeren en bestaande topologieën aanpassen. Cijfers van fylogenetische bomen worden veel gebruikt in publicaties om het resultaat van een evolutionaire analyse te illustreren. Omdat men echter niet moeiteloos een machine-leesbare representatie kan extraheren, d.w.z. een Newick-expressie, van de fylogenie uit dergelijke beelden, zijn die niet geschikt voor latere reanalyse of eenvoudige compilatie van boomtopologieën. Daarom heeft een door de computer leesbare vertegenwoordiging van een gepubliceerde boom volledig met de hand gebouwd of door speciale toepassingen te gebruiken. Hier kan Bomennatcher Plus waardevol zijn. Het identificeert de topologie van een boom (b.v. een figuur van een publicatie) met gebruikersinteractie. De applicatie heeft een geavanceerde grafische gebruikersinterface die is gebaseerd op de Java Swing API. De nieuwe versie, Bomennatcher Plus, is vanaf nul ontwikkeld en biedt een stabiele grafische gebruikersinterface, gebruikt verbeterde methoden voor beeldverwerking en voor de analyse van de Topologie van de Topologie. In het bijzonder is het niet langer nodig om een afbeelding te preproces voordat u het in Tomennatcher Plus voedt. De nieuwe applicatie biedt alle image PreProcessing-tools die nodig zijn.


Treesnatcher Plus Gerelateerde software

Bazooka

Detecteert een veelvoud aan spyware, adware, Trojan, Keylogger, Foistware. ...

291 727 KB

Downloaden

Pop waren.s2

POPGENE.S2 is een gratis programma waarmee u de populatie-genetica kunt bestuderen. ...

1,071 5.6 MB

Downloaden