Visuig

Pathway-analyse eenvoudig gemaakt.
Download nu

Visuig Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • VisANT Team
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 375 KB

Visuig Tags


Visuig Beschrijving

Visant is een unieke, handige, gemakkelijk te gebruiken, eenvoudige applicatie speciaal ontworpen om u te helpen met netwerk- en route-analyse. Visant is geschreven met behulp van de Java-ontwikkelingstaal. Belangrijkste kenmerken: Netwerkmodule Verrijking Analyse (NMEA) om fenotypisch verschil te detecteren tussen twee gegevenssets (bijvoorbeeld genexpressie van ziekte V.S. Normaal), probeer NMEA voor celcyclusroute in P53 Mutant-gegevens. NMEA wordt ingeschakeld om functionele modules te vinden die fenotypische verschillen informeren. Voor de huidige release zijn dergelijke verschillen meestal transcriptionele activiteit. NMEA Standaard wordt uitgevoerd voor alle niet-ingebedde metanoden. De functie is beschikbaar in het menu Expression en vereist de invoer van expressiegegevens (voorbeeldexpressiegegevens). Wanneer de uitvoering van NMEA is voltooid, worden de knooppunten in de modules gekleurd volgens hun verrijkingsscores GO-term verrijkingsanalyse (BODEA) om de overgegeven voorwaarden te vinden in netwerkmodules. De functie is beschikbaar onder het MOET-menu en vereist genen in de modules die worden geannoteerd. Batch-modus Automatiseert databasequery's voor interacties, naamresoluties en gaan annotaties, Batch-modus om batchprocessen op de achtergrond te automatiseren en om grootschalige netwerken met miljoenen knooppunten en randen te behandelen. Meta-graph: multi-schaal visualisatie van bio-netwerken, ideaal voor netwerk van functionele modules, Snelle batch laden van grote interactiegegevens ingesteld via interactie statistiekenpagina. Flexibel Visueel schema van het netwerk: Aangepaste NODEDEDGE annotatie, Integrative Data-Mining: 405K + Functional Associations (Experimental: 98924, Computerational: 307017) voor 103 soorten, naam normalisatie voor gist, vlieg, homo sapiens enz., Instelbare hoge prestaties, ondersteunt groot-netwerk, test is uitgevoerd met 226K + randen en knooppunten Eenvoudige HTTP-koppeling naar uw netwerk en ingebouwde ondersteuning van SVG van hoge resolutie -uitdrukking Overlay van het netwerk / pad Geïntegreerd expressiegegevens-gebaseerd aanbevelingssysteem voor gen in hetzelfde pad / complex / netwerk verkennend navigatie van KEGG-paden. -ondersteuning van gewogen netwerk met behulp van randdikte of randkleur of beide.


Visuig Gerelateerde software

Shiat

Genereert plots van site-wise variatie langs een sequentie-uitlijning ...

188 995 KB

Downloaden