Voroprot Een hulpmiddel voor de analyse van geometrische kenmerken van eiwitstructuur
Download nu

Voroprot Rangschikking & Samenvatting

Voroprot Tags

structuur Geometrie geometrisch eiwit geometrische Synthesizer analystic geometrische geometrische analyse Geometrische modelleringstool geometrische screensaver Bekijk eiwitstructuur Prote-eiwitstructuur weergeven eiwit analyse structuur analyse Geometrische Multigrid-bibliotheek Eiwitstructuur Geometrische eiwitkenmerken Eiwit Data Bank-analyse eiwit-codering gen-analyse Ontdek de eiwitstructuur Eiwitsequenties-analyse eiwit families analyse hersenstructuuranalyse Periodieke structuuranalyse Data Structure Analyse Eiwit 3D-structuur

Voroprot Beschrijving

Het vermogen om geometrische kenmerken van driedimensionale (3D) eiwitstructuur te analyseren en te visualiseren is fundamenteel voor studies van eiwit vouwen, residuenverpakking, docking-, eiwit-eiwit-interacties, enz. Sommige van de geavanceerde geometrische datastructuren maken het mogelijk om dit te kunnen uitvoeren een analyse op een alomvattende manier. Met dit doel in gedachten hebben we Voroprot ontwikkeld, een interactief hulpmiddel voor de analyse van geometrische kenmerken van eiwitstructuur. We hebben met name besloten om een deel van de geometrische methoden te bieden, niet opgenomen in andere vergelijkbare softwarepakketten. Voroprot construeert en toont Apollonius-diagram (ook bekend als Voronoi-diagram van sferen) en Apollonius-grafiek (ook bekend als Delaunay-triangulatie van bollen) van eiwitatomen, gezien elk atoom een 3D-bol van Van der Waals radius te zijn. Voroprot ontleent eiwitatomen Contactoppervlakken en oplosmiddeltoegankelijke oppervlakken van Apollonius-diagram en kunnen hun visualisatie mogelijk zijn. Bovendien kan het holtes binnen de eiwitstructuur vinden en weergeven. Om Apollonius-diagram in Voroprot te construeren, gebruikten we onze eigen algoritme-implementatie, die niet alleen kan worden toegepast voor eiwitatomen, maar ook voor elke reeks punten of bollen in 3D. Geef Voroprot A Probeer zijn capaciteiten volledig te beoordelen!

Voroprot Gerelateerde software