Wk Wavelet-based Quantification Algoritme voor ITRAQ
Download nu

Wk Rangschikking & Samenvatting

Wk Tags

signaal ion

Wk Beschrijving

WKANT is een algoritme dat een op wavelet gebaseerde analyse gebruikt voor het identificeren en extraheren van ITRAQ-reporterionsignalen om kwantificering te bereiken. Het is ook een integratief onderdeel van de Pijplijn OCAP MS-gegevensanalyse. Het programma is stand-alone en vereist geen afzonderlijk installatieproces. Extractief het programma en voer "wquant.exe" uit. Het programma is samengesteld in C ++ onder Microsoft Windows, met behulp van Visual Studio 2008. Visual Studio 2008 C ++ Runtime-bibliotheek is vereist om het programma uit te voeren. WQUANT HEEFT 5 PARAMETERS EN DE SYNTAX IS: WQUANT.EXE · Spectra-bestand]: Volledig pad en naam van het Spectra-bestand in MGF-formaat. · X! Tandem Resultaatbestand]: Volledig pad en naam van de uitvoer van X! Tandem. · Itraq Multiplex]: 4-Plex-experiment of een 8-plex experiment, "4" of "8". · X! Tandem e-score cutoff]: Identificatie cutoff voor kwantificering. · Kwantificatiemethode]: 3 manieren om de ionenintensiteit te berekenen: "Intensiteit", "trapezoïde", en "AUC" het gebied onder de curve.

Wk Gerelateerde software