neuroconstruct 3D-biofysisch gedetailleerde neurale netwerkmodellering
Download nu

neuroconstruct Rangschikking & Samenvatting

neuroconstruct Tags

neuraal netwerk netwerk neuron Computational Neurowetenschap

neuroconstruct Beschrijving

Neuroconstruct is een betrouwbare toepassing die is gemaakt om de ontwikkeling van complexe netwerken van biologisch realistische neuronen te vereenvoudigen, d.w.z. modellen met dendritische morfologieën en realistische celmembraan-geleidingen. Het wordt geïmplementeerd in Java en genereert scriptbestanden voor de Neuron- en Genesis-simulators, met ondersteuning voor andere simulatieplatforms (inclusief PSICS, Moose en Pynn) in geavanceerde stadia van ontwikkeling. Het maakt gebruik van de nieuwste neuroml-specificaties, waaronder MorpML, ChannelML en NetworkML. Ontwikkeling van deze software werd mogelijk gemaakt met financiering van de Wellcome Trust, de medische onderzoeksraad en het EU-synaps-project. Belangrijkste kenmerken: neuroconstruct kan morfologie-bestanden importeren in Genesis, Neuron, Neurolucida, SWC en Morphml-formaat voor opname in single cel of netwerkmodellen, of meer abstracte cellen kunnen ook handmatig worden gebouwd. het creëren van netwerken van geleidende neuronen gepositioneerd in 3D complexe connectiviteitspatronen tussen celgroepen kunnen worden opgegeven voor de netwerken Simulatie-scripts kunnen worden gegenereerd voor Neuron, Genesis, Moose, PSICS en Pynn-simulators (Opmerking: niet elk project kan worden gegenereerd voor elke simulator) biofysisch realistische cellulaire mechanismen (synapsen / kanaalmechanismen) kunnen worden geïmporteerd uit native scriptbestanden (* .mod of * .g) of gemaakt van sjablonen met channelml Automatische generatie van de code om simulatiegegevens en visualisatie / analyse van gegevens in neuroconstruct op te nemen Opgenomen simulatie-runs kan worden bekeken en beheerd via de Simulation Browser-interface Een op Python gebaseerde scripting-interface kan worden gebruikt om het genereren en de uitvoering van het model te regelen, waardoor meerdere simulaties worden uitgevoerd voor cel- en netwerkmodeloptimalisatie

neuroconstruct Gerelateerde software