Shiat

Genereert plots van site-wise variatie langs een sequentie-uitlijning
Download nu

Shiat Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • GPL
  • Naam uitgever:
  • Joe Parker
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 995 KB

Shiat Tags


Shiat Beschrijving

De naam Shiat staat voor Shannon Heterogeniteit in alignments-tool. Shiat genereert plots van site-wise variatie langs een sequentie-uitlijning (inclusief de maatregelen van de SHANNON entropie en de afstandsafstand). Deze applicatie biedt een intuïtieve grafische interface voor de gelijktijdige berekening van drie maatregelen van situieuze variatie in DNA- of RNA-uitlijningen. De Shannon Information Index, Hamming-afstand en (1-consensusfrequentie) worden allemaal berekend en weergegeven in een reeks grafische percelen. Meerdere uitlijningen kunnen worden geïmporteerd en vergeleken en een gegevensweergave-paneel kan eenvoudig kopiëren en plakken in externe toepassingen. Vier maatregelen worden geïmplementeerd: - Shannon-informatie entropie (op positie) - 1- (consensusfrequentie) (op positie) - 1- (heterozygosity-index H) (op positie) - Hamming-afstand (samengevat paarsgewijs over uitlijning)


Shiat Gerelateerde software