AMEN AMEN is een uniforme reeks gereedschappen om biologische veelzijdige high-throughput-gegevens te beheren, te verkennen en te combineren.
Download nu

AMEN Rangschikking & Samenvatting

AMEN Tags

in kaart brengen Biologische gegevens beheren biologische gegevens onderzoeken Chromosomale locatie biologisch chromosomaal

AMEN Beschrijving

Amen is een uniforme reeks gereedschappen om biologische veelzijdige high-throughput-gegevens te beheren, te verkennen en te combineren. Amen bevindt zich voor annotatie, mapping, expressie en netwerk en is een stand-alone, uniforme reeks gereedschappen om biologische veelzijdige veelvraaggegevens te beheren, te verkennen en te combineren, zoals annotatie, chromosomale locatie, expressie en interactiegegevens. Vereisten: · TCL / TK Wat is er nieuw in deze release: 7 modules: · Module om in te schatten als een biologische entiteit (eiwit voor exempel) meer genen / eiwitten in een cluster van genen in vergelijking heeft of regelt in vergelijking met hele genen (verrijking op regelgevende of interactienetwerken). Geschreven door Aurélie Lardenois. · Module om deze verrijkingen als een netwerk te visualiseren. Geschreven door Aurélie Lardenois. · Twee modules voor semi-gecontroleerde k-middelen en PAM-methoden. · Module om gen-set-bestanden (.gmt-bestanden van GSEA) toe te voegen aan het annotatiebestand. · Module om te normaliseren met positieve of negatieve besturingsgenen. · Module om de monsters in een expressiebestand te reorganiseren Twee veranderingen: · Bij het importeren van groepsbestanden worden ze nu gesorteerd in de alfabetische volgorde en vervolgens in AMEN geïmporteerd · De installatiemodule R-pakketten is gewijzigd.

AMEN Gerelateerde software