BIO :: MATRIX :: PSM :: Instenenite BIO :: MATRIX :: PSM :: InstenSite is een PSM-site-incuratie.
Download nu

BIO :: MATRIX :: PSM :: Instenenite Rangschikking & Samenvatting

BIO :: MATRIX :: PSM :: Instenenite Tags

Perl-module site PSM-site plaats voorkomen PSM

BIO :: MATRIX :: PSM :: Instenenite Beschrijving

BIO :: MATRIX :: PSM :: Instancesite is een PSM-site-incuratie. BIO :: MATRIX :: PSM :: Instancesite is een PSM-site Occuratie. Synopsis Gebruik Bio :: Matrix :: PSM :: instancesite; #U kunt een instantie-object krijgen vanuit een bestand: mijn ($ gevallen, $ matrix) = $ somepsmfile-> parse_next; #Or van geheugen Mijn% Params = (SEQ => 'Tataat', ID => "Tatabox1", Toetreding => 'SSG00000122304', Midden => 'TB1', Desc => 'Tata box, experimenteel geverifieerd in PRM1-gen' , Relo's => - 35); abstracte interface naar PSM-site Occurrence (PSM Sequence Match). Instenenite-objecten kunnen worden gebruikt om een PSM te beschrijven (zie Bio :: Matrix :: PSM :: Sitematrix) Sequence-wedstrijden. Het gebruikelijke kenmerk van een dergelijke overeenkomst is sequentie-coördinaten, score, reeks en sequentie (gen) -identoetredingsnummer of een ander ID. Dit object erft van BIO :: Locatableseq (die de echte reeks definieert) en kan een sitematrix-object, gebruikt Om het CRE (CIS-Regulatory Element) te detecteren, of uit deze CRE. Wanneer vermeldt de documentatie dat de combinatie van de MOTIF ID en GEN (toetreding) uniek moet zijn, dit is niet helemaal waar - er is mogelijk meer dan één optreden van Hetzelfde CIS-regulerend element in het stroomopwaartse regio van hetzelfde gen. Daarom zou religs het derde element zijn om een echt unieke combinatie te creëren. Vereisten: · Perl

BIO :: MATRIX :: PSM :: Instenenite Gerelateerde software