BIO :: SEQ :: SEQWITHQUALITALITY BIO :: SEQ :: SEQWITHQUALITALITEIT IS EEN BIOPERL-Object Verpakken van een reeks met zijn kwaliteit.
Download nu

BIO :: SEQ :: SEQWITHQUALITALITY Rangschikking & Samenvatting

BIO :: SEQ :: SEQWITHQUALITALITY Tags

Perl-module object reeks bioperl Bioperl-object volgorde verpakking

BIO :: SEQ :: SEQWITHQUALITALITY Beschrijving

BIO :: SEQ :: SEQWithQuality is een Bioperl-object dat een reeks met zijn kwaliteit verpakt. BIO :: SEQ :: SEQWITHQUALITEIT IS EEN BIOPERL-Object Verpakking Een reeks met zijn kwaliteit. Synopsis Gebruik BIO :: BABINSEQ; Gebruik BIO :: SEQ :: Primalqual; # Make from Memory My $ Qual = BIO :: SEQ :: SEQWITHALITAL-> NIEUW (-KLAAND => '1020304050502010 ', -SEQ =>' Atcgatcg ', -ID =>' human_id ', -Accession_number => 'al000012',); # Make from Objects # First, maak een PrimarySEQ-object My $ SEQOBJ = BIO :: BIMINESQ-> NIEUW (-SEQ => 'ATCGATCG', -ID => 'Genefragment-12', -Accession_Number => 'x78121', - alfabet => 'DNA'); # Nu maken een pratricqual-object Mijn $ Qualobj = BIO :: SEQ :: Primalqual-> Nieuwe (-Hal => '1020304050502010 ', -ID =>' Genefragment-12 ', -Accession_number => 'X78121', -Alfabet => DNA '); # Nu maak het SEQWITHQUALAL-object mijn $ SWQOBJ = BIO :: SEQ :: SEQWITHQUALITALITEIT-> NIEUW (-NEQ => $ SEQOBJ, -CAL => $ QUALOBJ); # gedaan! $ SWQOBJ-> ID (); # De ID van het SEQWithality-object # mag niet overeenkomen met de de ID van de sequentie of # van de kwaliteit (controleer de pod, Luke) $ SWQOBJ-> SEQ (); # De reeks van het SEQWithality-object $ SWQOBJ-> QUAL (); # De kwaliteit van het SEQWithality-object # om delen van de reeks uit te komen. Print "sequence", $ SEQOBJ-> ID (), "met toetreding", $ SEQOBJ-> Toetreding, "en Desc", $ SEQOBJ-> DESK, "N"; $ string2 = $ seqobj-> subseq (1,40); Vereisten: · Perl

BIO :: SEQ :: SEQWITHQUALITALITY Gerelateerde software