Basic Local Uitlijnzoektool Een reeks overeenkomstenonderzoekprogramma's.
Download nu

Basic Local Uitlijnzoektool Rangschikking & Samenvatting

Basic Local Uitlijnzoektool Tags

uitlijning basisch lokaal Uitlijning zoeken heuristisch algoritme Zoek regio's

Basic Local Uitlijnzoektool Beschrijving

Een reeks gelijkenisonderzoeksprogramma's. Basic Local Uitlijn zoektool is in Short Blast is een reeks gelijkenisonderzoeksprogramma's die zijn ontworpen om alle beschikbare sequentiedatabases te verkennen, ongeacht of de query eiwit of DNA is. Het maakt gebruik van een heuristisch algoritme dat op zoek is naar lokale uitlijningen, en is daarom in staat om relaties tussen reeksen te detecteren die alleen geïsoleerde regio's van gelijkenis delen. Het kan lokaal worden uitgevoerd als een volledig uitvoerbaar en kan worden gebruikt om Blast-zoekopdrachten op te lopen tegen privé-, lokale databases of gedownloade kopieën van de NCBI-databases. Het werkt op Mac OS, Win32, Linux, Solaris, IBM AIX, SGI, Compaq OSF en HP-UX-systemen. Wat is er nieuw in deze release: · De Variabele BLASTDB-omgeving ondersteunt nu meerdere database-zoekpaden. Waar mogelijk wordt een kleinere eiwit-opzoektabel gebruikt om de prestaties te verbeteren. · FormagRPSDB ondersteunt nu databases die groter zijn dan 2G. · Seedtop ondersteunt nu zoekopdrachten met GI-lijsten. · De X3-waarde voor Blastn / Megablast is gecorrigeerd.

Basic Local Uitlijnzoektool Gerelateerde software