Bio :: BABINSQI BIO :: BABIERSEQI is een PERL-interface-definitie voor een BIO :: BABINSEQ.
Download nu

Bio :: BABINSQI Rangschikking & Samenvatting

Bio :: BABINSQI Tags

Perl-module koppel perl Perl-interface

Bio :: BABINSQI Beschrijving

BIO :: BIMINIELSEQI is een PERL-interfacedefinitie voor een BIO :: BABINSEQ. BIO :: BIMINIELSEQI is een PERL-interface-definitie voor een bio :: primaryseq.synopsis # bio :: primarseqi is de interfaceklasse voor sequenties. # Als u een nieuwkomer bent bij Bioperl, moet u # beginnen met BIO :: SEQ-documentatie. Deze # documentatie is voornamelijk voor ontwikkelaars met # Bioperl. # Om dit te testen is een SEQ-object $ OBJ-> ISA ("BIO :: BIERNEKEQI") || $ OBJ-> WORD ("$ OBJ implementeert de BIO :: Beparaktereqi-interface"); # Accessors $ String = $ OBJ-> SEQ (); $ substring = $ OBJ-> subseq (12,50); $ Display = $ OBJ-> Display_ID (); # voor menselijke weergave $ id = $ OBJ-> primair_id (); # Unieke ID voor dit object, # implementatie gedefinieerd $ uniek_key = $ OBJ-> TOEKOMSTIGE_NUMMER (); # Unieke biologische ID # Object Manipulatie Eval {$ REV = $ OBJ-> Revcom (); }; if ($ @) {$ obj-> gooien (-class => 'bio :: root :: uitzondering', -text => "kon geen aanvulling maken.". "WAARSCHIJNLIJK NIET DNA. WERKELIJKE uitzondering van $ @ N", -Value => $ @); } $ TRUNK = $ OBJ-> TRUCK (12,50); # $ REV en $ TRUCK zijn BIO :: BABINYSQI Compliant ObjectSTHIS-object definieert een abstracte interface voor basissequentie-informatie - voor de meeste gebruikers van het pakket zijn de documentatie (en -methoden) in deze klasse niet nuttig - dit is een alleen klasse die definieert Welke methoden moeten worden geïmplementeerd door andere PERL-objecten om te voldoen aan de BIO :: Beparaktereqi-interface. Ga "PERLDOC BIO :: SEQ" of "MAN BIO :: SEQ" voor meer informatie over de hoofdklasse voor sequenties.PrimarySEQ is een object alleen voor de reeks en de naam (en), niets meer. SEQ is het grotere object compleet met functies. Er is een pure perl-implementatie hiervan in BIO :: BABINSEQ. Als u gewoon BIO :: BABINYSEQ-objecten wilt gebruiken, lees dan eerst die module. Deze module definieert de interface en is van meer belang voor mensen die hun eigen PERL-objecten / RDBS / -bestandssystemen, enz. Indien willen wikkelen dat zij "Bioperl-sequentie-objecten zijn, hoewel het niet PERL gebruikt om de sequentie op te slaan. Deze interface definieert wat Bioperl nodig acht om "een sequentie" te zijn zonder een implementatie hiervan te verstrekken. (Een implementatie wordt verstrekt in BIO :: BIMBIERSEQ). Als u een BIO :: BABINYSEQ 'Compliant' -object wilt verstrekken dat in feite een ander object / database / out-of-perl-ervaring wikkelt, dan is dit het juiste ding om in te wikkelen, in het algemeen door een wikkelklasse te bieden die inheren van uw Object en deze Bio :: BeparaktereQi-interface. De wrapper-klasse zou dan methoden bevatten in de "implementatiespecifieke functies" die deze methoden voor uw object zouden verstrekken. Vereisten: · Perl

Bio :: BABINSQI Gerelateerde software