Bio :: Gmod :: GenericGenepage

Generieke GMOD-genpagina-klasse
Download nu

Bio :: Gmod :: GenericGenepage Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Perl Artistic License
  • Naam uitgever:
  • Scott Cain
  • Uitgever website:
  • http://search.cpan.org/~scain/

Bio :: Gmod :: GenericGenepage Tags


Bio :: Gmod :: GenericGenepage Beschrijving

Generieke GMOD-gen-pagina basisklasse BIO :: GMOD :: GenericGenepage is een abstracte perl-klasse om het gemakkelijker te maken voor modelorganalismedatabases (mods) om een eenvoudige XML te dienen die attributen van hun genmodellen beschrijft. Om dit te implementeren, moet de gebruiker BIO :: GMOD :: GenericGenPage en verstrek de hieronder vermelde methoden als abstracte klassen. Deze methoden worden vervolgens gebruikt door de Render_XML-methode om XML te maken voor een gegeven gen.Er is een voorbeeld implementatie bij deze distributie, BIO :: GMOD :: GenericGenepage :: Chado, een chado-adapter voor een gistendatabase afgeleid van SGD's GFF3. Om dit voor een andere Chado-database te implementeren, moet het redelijk eenvoudig zijn om de meegeleverde methoden te wijzigen om uw eigen adapter te maken. Parameciumdb kan bijvoorbeeld BIO :: GMOD :: GenericGenepage :: Chado en Creëer Bio :: Gmod :: GenericGenepage :: Chado :: Parameciumdb en alleen opheffen de data_provider en organisme methoden om een werkende adapter te hebben. Databases die niet op Chado zijn gebaseerd op Chado, hebben slechts iets meer werk, om alle abstracte klassen in BIO :: GMOD :: genericgenepage te implementeren. Andere voorbeeld implementatie is inbegrepen, CXGN :: Phenome :: GenericGenPage, maar dit is slechts een gedeeltelijk Implementatie en zal niet werken met de huidige release van BIO :: GMOD :: GenericGenepage.Synopsis My $ Page = BIO :: GMOD :: GenericGenEpage-> Nieuwe ($ Gene_Identifier); mijn $ xml = $ page-> render_xml (); Vereisten: · Perl


Bio :: Gmod :: GenericGenepage Gerelateerde software

Over ons