Bio :: Graphics :: Glyph :: CD's BIO :: Graphics :: Glyph :: CDS-module bevat de glyph van de CDS '.
Download nu

Bio :: Graphics :: Glyph :: CD's Rangschikking & Samenvatting

Bio :: Graphics :: Glyph :: CD's Tags

Perl-module graphics bio cds glyph Bio Graphics

Bio :: Graphics :: Glyph :: CD's Beschrijving

Bio :: Graphics :: Glyph :: CDS-module bevat de glyph van de CDS '. Bio :: Graphics :: Glyph :: CDS-module bevat de "CD's" Glyph.Synopsis Zie L en L . Deze Glyph dekent de kenmerken die zijn geassocieerd met een eiwitcoderingsgebied. Teken bij hoge vergrotingen een reeks dozen die kleurcodes zijn om het frame aan te geven waarin de vertaling optreedt. Trekt bij lage vergrotingen de aminozuursequentie van het resulterende eiwit. Aminozuren die worden gecreëerd door een splitsing worden optioneel weergegeven in een onderscheidende kleur. De volgende opties zijn standaard bij alle glyphs. Zie Bio :: Graphics :: Glyph voor een volledige uitleg. Optie Beschrijving Standaard ------- ------------ ------- -Fgkleur-voorgrond Kleur Zwart -OutlineColor Synoniem Voor -FgColor -Bgkleur Achtergrondkleur Turquoise -VillColor Synoniem voor -Bgolor - LineBidth Line Breedte 1 -Hoogte Hoogte van Glyph 10-Voor Glyph Lettertype GDSMallFont-Connector-connector Type 0 (FALSE) -Connector_Color Connector Kleur Zwart -Label Of u een label wilt tekenen 0 (FALSE) -decriptie Of u een beschrijving wilt tekenen 0 (FALSE) -Strand_Irow Of het nu om 0 (false) Stranddness -Hilite-Hooglichtkleur UndeDef (geen kleur) aan te geven, de uitlijning van Glyph herkent de volgende glyph-specifieke opties: Optie Beschrijving Standaard ---- --- -------- -frame0f kleur voor eerste (+) frame achtergrond kleur -frame1f kleur voor tweede (+) frame achtergrond kleur -frame2f kleur voor derde (+) frame achtergrond kleur -frame0r kleur voor de eerste (- ) Frame achtergrondkleur -frame1r kleur voor tweede (-) frame achtergrond kleur -frame2r kleur voor derde (-) frame achtergrond kleur -gridcolor colo r voor het "personeel" LightLateGray -Sixframe Teken een personeel van zes frame 0 (FALSE; Trekt meestal 3 frame) -require_subparts Teken niet het leesframe 0 (FALSE) tenzij het een feature subpart is. -Codontable Codon Table om 1 te gebruiken (zie Bio :: Tools :: Codebontable) De optie -require_subparts wordt gesuggereerd bij het weergeven van gesplitste transcripties die meerdere CDS-subharts bevatten. Anders zal de glyph hickup wanneer ingezoomd een weg naar beneden op een intron tussen twee CDSS (verschijnt een fantoomreading). Voor onbewerkte sequenties, doen * niet * gebruik -require_subparts.requirements: · PERL-vereisten: · Perl

Bio :: Graphics :: Glyph :: CD's Gerelateerde software