Bio :: Index :: Blast BIO :: INDEX :: BLAST is een PERL-module met rapporten van indexen en ondersteunt ophalen op basis van query-toetreding (en).
Download nu

Bio :: Index :: Blast Rangschikking & Samenvatting

Bio :: Index :: Blast Tags

Perl-module rapporten Ontploffing Blast rapporten toetreding vraag

Bio :: Index :: Blast Beschrijving

Bio :: Index :: Blast is een PERL-module met rapporten van indexen en ondersteunt ophalen op basis van query-toetreding (en). Bio :: Index :: Blast is een PERL-module met rapporten van de indexen en ondersteunt het ophalen op basis van query-toetreding (en). Synopsis. Gebruik Bio :: Index :: Blast; mijn ($ indexfile, $ file1, $ file2); Mijn $ Index = Nieuwe Bio :: Index :: Blast (-FileName => $ Indexfile, -Write_Flag => 1); $ index-> make_index ($ file1, $ file2); mijn $ ID; Mijn $ Data = $ Index-> Get_Stream ($ ID); mijn $ bflite_report = $ index-> fetch_report ($ id); Print "Query is", $ BPLITE_Report-> Query, "N"; terwijl (mijn $ sbjct = $ bflite_report-> nextsbjct) {print $ sbjct-> naam, "n"; terwijl (mijn $ HSP = $ SBJCT-> NEXTHSP) {print "t e-waarde", $ HSP-> P,} afdrukken "N"; } Dit object stelt u in staat een index op een BLAST-bestand (of bestanden) te bouwen en een snelle toegang tot het BLAST-rapport voor die toetreding te bieden. Opmerking: voor het beste resultaat 'Strikte'. Vereisten: · Perl

Bio :: Index :: Blast Gerelateerde software