Bio :: SEQIO :: FASTA BIO :: SEQIO :: FASTA is een PERL-module met fasta-sequentie-ingang / uitgangsstroom.
Download nu

Bio :: SEQIO :: FASTA Rangschikking & Samenvatting

Bio :: SEQIO :: FASTA Tags

Perl-module reeks fasta sequentie fasta bioperl uitvoerstroom

Bio :: SEQIO :: FASTA Beschrijving

BIO :: SEQIO :: FASTA is een PERL-module met fasta-sequentie-ingang / uitvoerstroom. BIO :: SEQIO :: FASTA is een PERL-module met FASTA SEQUENTIE-INPUT / OUTPUT STREAM.APPENDIONDe rest van de documentatie Details elk van de objectmethoden. Interne methoden worden meestal voorafgegaan met een _next_SEQ-titel: Next_SEQ Gebruik: $ SEQ = $ STREAM-> NEXT_SEQ () FUNCTION: Retourneert de volgende volgorde in de stream-rendementen: BIO :: SEQ Object Args: NONEWRITE_SEQ Titel: Write_SEQ Gebruik: $ Stream- > Write_SEQ (@SEQ) Functie: schrijft het $ SEQ-object in de stream-retouren: 1 voor succes en 0 voor fout Args: array van 1 tot n bio :: primaireSeqi Objectswidth Titel: Breedte Gebruik: $ OBJ-> Breedte ($ NEWVAL ) Functie: Get / set de lijnbreedte voor FASTA-uitgang Retouren: waarde van breedte Args: NEWVALUE (optioneel) Preferred_id_type Titel: Preferred_Id_Type Gebruik: $ OBJ-> Preferred_Id_Type ('Toetreding') Functie: Get / set het voorkeurstype identificatie Gebruik in de positie "> ID" voor FASTA-uitvoer. Retourneren: String, een van de waarden gedefinieerd in @bio :: SEQIO :: FASTA :: SEQ_ID_TYPES. Standaard = $ BIO :: SEQIO :: FASTA :: Default_SEQ_ID_TYPE ('Display'). Args: string bij het instellen. Dit moet een van waarden zijn die zijn gedefinieerd in @bio :: SEQIO :: FASTA :: SEQ_ID_TYPES. Toegestane waarden: toetreding, toetreding. Sversie, display, primaire worpen: fatale uitzondering Als het meegeleverde ID-type niet in @seq_id_types is. Vereisten: · Perl

Bio :: SEQIO :: FASTA Gerelateerde software