Bio :: SEQIO :: FASTQ BIO :: SEQIO :: FASTQ is een FASTQ-sequentie-ingang / uitvoerstroom.
Download nu

Bio :: SEQIO :: FASTQ Rangschikking & Samenvatting

Bio :: SEQIO :: FASTQ Tags

Perl-module reeks Invoer / Uitgangsstroom fastq sequentie fastq

Bio :: SEQIO :: FASTQ Beschrijving

BIO :: SEQIO :: FASTQ is een FASTQ-sequentie-ingang / uitvoerstroom. BIO :: SEQIO :: FASTQ is een FASTQ-sequentie-ingang / uitgangsstroom.Synopsisdo Gebruik deze module niet rechtstreeks. Gebruik het via de BIO :: SEQIO-klasse.Dit object kan transformeren BIO :: SEQ en BIO :: SEQ :: SEQWITHQUALLALY Objecten van en naar FASTQ Flat-bestand databases.fastq is een bestandsformaat dat vaak in het Sanger Center wordt gebruikt om een fasta te bundelen Volgorde en kwaliteitsgegevens. Een typisch FASTAQ-invoer neemt de van: @ HCDPQ1D0501 GatttgggtttcaagcagtatcggggtttcaagcagtatcggggttagaAgcagtcgatcaaatagaaatccattcttttcaactcacagtttttttttcaactcacagtttt ..... + HCDPQ1D0501! '' * (((*** +)) %%%%%%). 1 *** + * '')) ** 55CCF >>>>>> CCCCCCC65 ..... FASTQ-bestanden hebben sequentie en kwaliteitsgegevens op een enkele regel en de kwaliteitswaarden zijn single-byte gecodeerd. Om de decimale waarden op te halen voor kwaliteiten, moet u 33 (of octal 41) van elke byte aftrekken en vervolgens converteren naar een geheel getal van 2 cijfers + 1 spatie. U kunt controleren of 33 het juiste nummer is, omdat de eerste byte altijd is '!' komt overeen met een kwaliteitswaarde van 0Requirements: · PERL-vereisten: · Perl

Bio :: SEQIO :: FASTQ Gerelateerde software