Bioperl

A PERL-extensies voor bio-informatica.
Download nu

Bioperl Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Artistic License
  • Prijs:
  • FREE
  • Naam uitgever:
  • Bioperl developers
  • Uitgever website:
  • http://bio.perl.org/

Bioperl Tags


Bioperl Beschrijving

Een perl-extensies voor bioinformatica. Bioperl-project is een verzameling Perl-modules die de ontwikkeling van PERL-scripts voor bio-informatica-toepassingen vergemakkelijken. Als zodanig omvat het niet klaar om programma's in de zin te gebruiken die veel commerciële pakketten en gratis web-gebaseerde interfaces doen (bijv. Entrez, SRS). Aan de andere kant, Bioperl levert herbruikbare PERL-modules die het schrijven van Perl-scripts voor volgorde faciliteren Manipulatie, toegang tot databases met behulp van een reeks gegevensformaten en uitvoering en het parseren van de resultaten van verschillende moleculaire biologie-programma's, waaronder straal, clustalw, tcoffee, genscan, estscan en hmmer. Dientengevolge kan Bioperl het ontwikkelen van scripts die grote hoeveelheden sequentiegegevens kunnen analyseren op manieren die typisch moeilijk of onmogelijk zijn met webgebaseerde systemen. Om te profiteren van Bioperl, heeft de gebruiker een basiskennis van de Perl-programmeertaal behoefte aan Hoe Perl-referenties, modules, objecten en methoden te gebruiken. Als deze concepten onbekend zijn, wordt de gebruiker verwezen naar een van de verschillende inleidende of tussenliggende boeken op Perl. We vonden de Perl-kerntaal van S. Holzmer, Coriolis-technologie, bijvoorbeeld. Deze tutorial is niet bedoeld om de fundamenten van Perl te onderwijzen aan mensen met weinig of geen ervaring in de Perl-taal. Aan de andere kant is de geavanceerde kennis van PERL - zoals het schrijven van een objectgeoriënteerde PERL-module - niet vereist voor succes met behulp van BioPerl.bioperl is open source-software die nog steeds onder actieve ontwikkeling is. De voordelen van open source-software zijn bekend. Ze omvatten de mogelijkheid om de broncode en vrijstelling van softwarelicentieverkosten vrijelijk te onderzoeken en aan te passen. Hoewel open source-software meestal wordt ontwikkeld door een groot aantal vrijwilligersprogrammeurs, is de resulterende code vaak niet zo duidelijk georganiseerd en de gebruikersinterface niet zo gestandaardiseerd als in een volwassen commercieel product. Bovendien, in elk project onder actieve ontwikkeling, kan de documentatie niet bijhouden met de ontwikkeling van nieuwe functies. Dientengevolge is de leercurve voor actief ontwikkelde, open source source software soms steil. Vereisten: · Perl Wat is er nieuw in deze release: · Dit is de eerste kernrelease in de 1,6-serie en de eerste stabiele release na 5 jaar ontwikkelingsberichten.


Bioperl Gerelateerde software

MPIBLAST

MPIBLAST is een op MPI-gebaseerde parallelle implementatie van NCBI-ontploffing. ...

434

Downloaden

ASCO

ASCO-project heeft tot doel om optimalisatiecapaciteiten te brengen aan bestaande specerijenimulators. ...

167

Downloaden

Le Petit Poucet

Le Petit Poucet is gratis software om GPS-routes en tracks in een 3D-scène weer te geven en te bewerken. ...

141

Downloaden

Saga gis

SAGA GIS (Systeem voor geautomatiseerde geo-wetenschappelijke analyse) is een geografisch informatiesysteem (GIS). ...

1,828

Downloaden