Chemie :: Bestand :: PDB Eiwit Data Bank File Format Reader / Writer
Download nu

Chemie :: Bestand :: PDB Rangschikking & Samenvatting

Chemie :: Bestand :: PDB Tags

lezer perl pdb Pdb lezer VOB schrijver Eiwit Data Bank

Chemie :: Bestand :: PDB Beschrijving

Protein Data Bank File Format Reader / Writer Chemie :: Bestand :: PDB is een PERL-module die PDB-bestanden leest en schrijft. Het PDB-bestandsformaat wordt gewoonlijk gebruikt om eiwitten te beschrijven, met name die welke zijn opgeslagen in de eiwitgegevensbank (http://www.rcsb.org/pdb/). De huidige versie van deze module leest alleen de volgende recordtypen, negeert al het andere: Atom Hetatm EndMDL SteitDeze Module registreert automatisch het 'PDB'-formaat met chemie: mol, zodat PDB-bestanden kunnen worden geïdentificeerd en gelezen door chemie :: Mol- > Lees (). Voor autodetectie purpuses gaat ervan uit dat bestanden die eindigen in .pdb of een lijnvergelijking / ^ (atoom | hetatm) / PDB-bestanden zijn. De PDB-lezer en schrijver is ontworpen voor het omgaan met chemie: Macromol-objecten, maar het kan ook maken en gebruik de chemie: molobjecten door wat informatie weg te gooien. Synopsis Gebruik chemie :: Bestand :: PDB; # Lees een PDB-bestand Mijn $ Macro_Mol = Chemistry :: Macromol-> Lees ("MyFile.pdb"); # Schrijf een PDB-bestand $ macro_mol-> schrijven ("out.pdb"); # Lees alle modellen in een multi-modelbestand mijn @mols = chemie :: macromol-> lezen ("modellen.pdb"); # Lees één model per keer mijn $ bestand = chemie :: macromol-> bestand ("modellen.pdb"); $ Bestand-> Open; Terwijl (mijn $ Mol = $ Bestand-> Read_Mol ($ Bestand-> FH)) {# Doe iets met $ Mol} Vereisten: · Perl

Chemie :: Bestand :: PDB Gerelateerde software