Compbio :: db COMPBIO: DB is een PERL-module met methoden voor toegang tot gegevens opgeslagen Acorling naar het Compbio Base-schema.
Download nu

Compbio :: db Rangschikking & Samenvatting

Compbio :: db Tags

Perl-module gegevens toegang toegang tot gegevens CompBio basisschema

Compbio :: db Beschrijving

COMPBIO :: DB is een PERL-module met methoden voor toegang tot gegevens opgeslagen Acorling naar het Compbio Base-schema. Compbio :: DB is een PERL-module met methoden voor toegang tot gegevens die zijn opgeslagen volgens de Compbio Base Schema.Synopsis Gebruik Compbio :: DB; Mijn $ CBDB = Compbio :: DB-> NIEUW ({host => "foo.bar.edu"); Mijn $ AR_DEFS = $ CBDB-> Get_annotation (); Voorbeeldcode voor het parseren van de rendement voor een eenvoudige afdruk: mijn $ AR_RESULT = $ CBDB-> GET_AA_SEQ (@id_list); foreach mijn $ ar_row (@ $ ar_result) {volgende tenzij @ $ ar_row; Print join ("t", @ $ ar_row), "n"; } # Return listThis-module en de gerelateerde database-schema's waar ontwikkeld om te worden gebruikt met een MySQL-server. Hoewel ik het zeker de voorkeur zou geven om draagbaar te zijn, was dat op dit moment geen prioriteit. Ik verwacht echter de handmatige wijzigingen die nodig zijn om deze module te gebruiken, moeten zeer redelijk zijn voor iemand die voldoende bekend is met de nieuwe doeldatabase-server, en ik zou graag samenwerken met iedereen die hieraan wil werken! Meestal van de methoden In deze database haalt u een type gegevens uit een gegeven ID of lijst met ID's. Tenzij anders vermeld voor een specifieke methode, worden slechts twee argumenten ooit gebruikt; de ID of een array-verwijzing naar een lijst met ID's en een hash-referentie met eventuele optionele argumenten. Het verzoek wordt gemaakt tegen de standaarddatabase die is gedefinieerd wanneer het COMPBIO :: DB-object is gemaakt, maar de meeste methoden accepteren een "database" -optie om een andere database op dezelfde server te gebruiken .Alle methoden die resultaten retourneren 2D-array. Zie de documentaion voor specifieke methoden voor de volgorde van geretourneerde velden. Vereisten: · Perl

Compbio :: db Gerelateerde software