Emaans EMAN is een reeks wetenschappelijke beeldverwerkingshulpmiddelen die voornamelijk zijn gericht op de transmissie-elektronenmicroscopie-gemeenschap.
Download nu

Emaans Rangschikking & Samenvatting

Emaans Tags

afbeelding verwerken afbeelding verwerken nanoschaalmoleculen EMAN

Emaans Beschrijving

Eman is een reeks wetenschappelijke beeldverwerkingshulpmiddelen die voornamelijk gericht zijn op de transmissie-elektronenmicroscopie-gemeenschap. EMAN is een reeks wetenschappelijke beeldverwerkingshulpmiddelen die voornamelijk zijn gericht op de transmissie-elektronenmicroscopie-gemeenschap, hoewel het ook begint te worden gebruikt in andere gebieden. Het heeft een bijzondere focus op het uitvoeren van een taak die bekend staat als een enkele deeltjesreconstructie. In deze methode worden afbeeldingen van nanoschaalmoleculen en moleculaire samenstellen ingebed in glasachtig (glazig) ijs verzameld op een transmissie-elektronenmicroscoop en vervolgens worden verwerkt met EMAN om een compleet 3 te produceren -D recoFructie bij resoluties naderen nu de atoomresolutie. Voor structuren met lage resolutie (~ 2 nm) kan dit nodig hebben ~ 8 uur computerverwerking en een paar duizend deeltjes. Voor structuren gericht op ~ 0,5 nm of betere resolutie, honderdduizenden deeltjes en honderdduizenden CPU-uren ( op grote computationele clusters) kan nodig zijn. Eman wordt inderdaad vaak gebruikt in supercomputerfaciliteiten als een testaanvraag voor grootschalige computergebruik. Wetenschappelijke beeldverwerking onderscheidt zich van de typische 'Photoshop'-beeldverwerking doordat het analyitief is in de natuur. Afbeeldingen verwerkt in Eman zijn drijvende point Greyscale-afbeeldingen. Dat wil zeggen, de pixelwaarden in de afbeeldingen worden weergegeven als reële getallen, niet als kleine gehele getallen (typische GIF / JPG / PNG-afbeeldingen zijn beperkt tot integrale waarden van 0-255 voor elke pixel). Processing bevat vaak complexe beeldverwerkingsactiviteiten in Fourier of wavelet-ruimte. EMAN werd voor het eerst vrijgegeven in 1999 en is sindsdien onder continue ontwikkeling geweest. Het bestaat uit een C ++ -bibliotheek van honderden verschillende algoritmen voor beeld / volume verwerking met bindingen in de populaire taal van Python Scripting. In nieuwe EMAN-ontwikkeling zijn alle gebruikersniveauprogramma's (waarvan er meer dan 200 in EMAN 1.8) zijn ontwikkeld in Python, waardoor de goed geïnformeerde eindgebruiker wijzigingen kan aanbrengen zonder een van de C ++ broncode te hoeven downloaden of compileren In deze release: · substantiële verbeteringen werden aangebracht in Refine2D.py. · Het gebruik van refine2d.py op alle nieuwe datasets wordt sterk gesuggereerd. · Sommige programma's gebruiken de EMAN2-stijl van argumenten, ie "Programma -" -Option = waarde " , in plaats van de oude stijl, "Programma Optie = Value". · Er is een nieuw HDF5-formaat dat compatibel is met EMAN2. · Nieuwe Airs-programma's werden toegevoegd, zoals "skeleton". · Nieuwe opties zijn toegevoegd om te verfijnen Beter op grote icosahedrale objecten. · De parallellism-infrastructuur werd verbeterd, hoewel netwerkgerelateerde problemen nog steeds kunnen bestaan. · Willekeurige modelgeneratie in makeinitialmodel.py was opgelost.

Emaans Gerelateerde software