Flipdcd FlipDCD Het keert het endianisme van binaire DCD Moleculary Dynamics Trajectory-bestanden om.
Download nu

Flipdcd Rangschikking & Samenvatting

Flipdcd Tags

dynamica traject Dynamics Traject Flipdcd

Flipdcd Beschrijving

FlipDCD Het keert het endianisme van binaire DCD Molecular Dynamics Trajectory-bestanden om. FlipDCD is een klein hulpprogramma voor het omkeren van het endianisme van binaire DCD-trajectbestanden van Charmm, en Naam. Dit kan handig zijn bij het uitvoeren van simulaties op één architectuur en visualiseren of analyseren van de resultaten op een andere. FIXDCD is een klein hulpprogramma om de koptekst van een X-Plor DCD-bestand aan te passen om het leesbaar te maken door programma's die de kosten van Charmm DCD-bestanden hebben verwacht, Een Timestep-waarde in de header.FIPDCD biedt een mechanisme voor het omzetten van het endianisme (byte-bestellen) van Charmm, X-Plor en NAMD DCD-trajectbestanden, zodat ze kunnen worden geladen door visualisatie- en analyseprogramma's op platforms met de tegenovergestelde byte-bestellen Van het platform waarop ze oorspronkelijk werden gegenereerd. Dit maakt het mogelijk om een Windows-pc te gebruiken om DCD-trajecten te lezen die op een zon of een SGI zijn gegenereerd en een zon of een SGI toestaat om trajectbestanden op een pc-cluster te lezen De endianness-conversie per geheugen in kaart brengen met het DCD-bestand met MMAP () en het omzetten van het endianisme in de plaats. Dit biedt een relatief hoge prestatiemethode om endianness-conversie uit te voeren.FIPDCD kan worden gebruikt om de endiaanse status van DCD-bestanden te melden of om een bepaalde endianness te forceren zonder rekening te houden met de oorsprong van de DCD-bestanden.FIPDCD-gebruik: FlipDCD bestand. . . Waar "File" een lijst met bestanden kan zijn. Het standaardgedrag is om de byte-bestellen te draaien. Andere opties zijn: -S Rapporteer de byte-orderstatus van elk bestand zonder het te wijzigen -B Merk / Houd elk bestand Big-Endian -L Make / Bewaar elk bestand Little-Endian de opties zijn wederzijds exclusief; De laatste lees wordt gebruikt. FilmDCD verandert de koptekst op een DCD-bestanden van X-Plor-stijl, zodat ze kunnen worden gelezen door hulpmiddelen die verwachten van Charmm geformatteerde trajectbestanden. Net als bij FlipDCD voert FixDCD de conversie in de plaats uit. Deze conversie is niet omkeerbaar, zodat u misschien een back-upkopie van uw bestand (en) wilt maken.

Flipdcd Gerelateerde software