Genomorama: genoomvisualisatie Genomorama: Genome Visualisatie is een multi-schaal, multi-genoom, multi-platform visualisatie- en analyseprogramma.
Download nu

Genomorama: genoomvisualisatie Rangschikking & Samenvatting

Genomorama: genoomvisualisatie Tags

visualisatie genoom visualisatieprogramma Genoomvisualisatie analyseprogramma Genomorama

Genomorama: genoomvisualisatie Beschrijving

Genomorama: Genome Visualisatie is een multi-scale, multi-genoom, multi-platform visualisatie- en analyseprogramma. Genomorama: Genome Visualisatie is een multi-scale, multi-genoom, multi-platform visualisatie- en analyseprogramma. Het biedt een krachtige maar eenvoudig te gebruiken interface die gebruik maakt van de visualisatiekracht van moderne computers (via OpenGL) en de substantiële bio-informatische infrastructuur die wordt verstrekt door de NCBI (via de NCBI C-toolkit). Genomorama is geschreven in draagbaar, zeer geoptimaliseerd C ++ en wordt geleverd in drie "smaken" waarmee het native op (meest) moderne besturingssystemen kan uitvoeren: OS X (met behulp van koolstof), Microsoft Windows (met MFC) en Linux (met behulp van MOTIF) . Executables- en broncode zijn vrij beschikbaar voor alle smaken. Hier zijn enkele belangrijke kenmerken van "genomorama-genoomvisualisatie": · Hoge prestaties zijn niet opgeofferd op het altaar van draagbaarheid · OpenGL Graphics Profiteer van de video-game geoptimaliseerde grafische kaarten die beschikbaar zijn De meeste desktop- en laptopcomputers. · C ++ maakt transparant en volledig gebruik van systeembronnen (zoals geheugen) mogelijk. · Native windowing-toolkits (koolstof, MFC en motief) voor elk besturingssysteem faciliteren reacties en gebruiksgemak. · Een stand-alone, zelf -Gemonteerd uitvoerbaar Gevronden genomorama van afhankelijkheid van applicaties van derden. · Broncode voor alle platforms is vrij beschikbaar. · Een aantrekkelijke, volledige uitgeruste gebruikersinterface · Genomorama presenteert een schone, overzichtelijke gebruikersinterface. · Multi-scale rendering geeft relevante details weer tijdens het handhaven leesbaarheid. · Gebruik een toetsenbord of een muis tot efficiënt zoomen, pan en verkennen van genomomen van willekeurige omvang. · Aantrekkelijk WYSIWYG PostScript en GIF Put Formations Yield Publication Quality-afbeeldingen. · Nieuwe functies om Genome Analyse te helpen · Naast de standaard zoekopties (zoals query per sequentie en gennaam) biedt Genomorama "voorwaartse en achteruit" DNA-hybridisatie gebaseerde zoekopdrachten. · Geef een PCR-primers en genomorama zal de amplicons uitvoeren. · Zorg voor een hybridisatie-sonde en genomorama vindt bindende sites. · Geef een paar hangslot-probes en genomorama zal bindende locaties identificeren · Geef een set PCR-primercriteria (lengte, smelttemperatuur, basissamenstelling, enz.) En genomorama Primers. · Genomorama kan een willekeurig aantal genomen weergeven en doorzoeken (alleen beperkt door computergeheugen). · Harnesseer de kracht van de NCBI-toolkit om rechtstreeks toegang te krijgen tot en doorzoek de NCBI Entrez-database. · Meltend profiel, naast de traditionele basissamenstelling Percelen (ie% g + c,% a + t, enz.). Wat is nieuw in deze release: · Deze release fixeert de volgende bugs: GBK-bestanden parseren met enkele basisannotaties op de aanvullingstreng; · Gemiste exacte overeenkomsten bij 3 'einde van de doelvolgorde; · Breekbaar parseren van annotatiebereik; · Downloaden van zeer grote Genbank-records (d.w.z. menselijke chromosomen); · En verlaten intergene ruimte na enkele basisannotaties (d.w.z. SNPS). · Custom Color Records worden nu opgeslagen en lezen van GBK-bestanden. · Er is een OS X Intel-specifiek uitvoerbaar bestand toegevoegd. · Het dialoogvenster Informatie is opzettelijk gemaakt.

Genomorama: genoomvisualisatie Gerelateerde software