Grammy Genome relatieve overvloed met behulp van mengselmodellen
Download nu

Grammy Rangschikking & Samenvatting

Grammy Tags

Python-bibliotheek genoom metagenomic overvloed Mixture Models metagenomic overvloed

Grammy Beschrijving

Genoom Relatieve overvloed met behulp van mengselmodellen Grammy is een Python-module die hulpmiddelen levert voor de schatting van de metagenomische abundante schatting op basis van leesfeesten (uitlijning of compositie gebaseerd). Grammy is een computationeel framework dat is ontwikkeld voor genoom-relatieve overvloed met behulp van mengselmodel Theory (Grammy) op schattingen. Nauwkeurige schatting van de microbiële communautaire samenstelling op basis van metagenomische sequentiegegevens is fundamenteel voor de analyse van Metagenomics.Prevalent-schattingsmethoden zijn voornamelijk gebaseerd op het rechtstreeks samenvattende uitlijningsresultaten of zijn varianten; vaak resulteren in vooringenomen en / of onstabiele schattingen. We hebben het genoom relatieve overvloed ontwikkeld met behulp van het mengselmodel Theory (Grammy) benadering schat genoom genoom Relatieve overvloed op basis van shotgun leests.granMy is aangetoond om schattingen te geven die nauwkeurig en robuust zijn in zowel gesimuleerde als echte benchmark datasets. Vereisten: · Python

Grammy Gerelateerde software