Kaïn Stochastische simulaties voor chemische kinetiek
Download nu

Kaïn Rangschikking & Samenvatting

Kaïn Tags

Scheikunde stochastisch chemische reacties Stochastische simulaties deterministisch

Kaïn Beschrijving

Stochastische simulaties voor chemische kinetiek Kaïn is in staat om stochastische en deterministische simulaties van verschillende chemische reacties uit te voeren. Het kan meerdere simulatieprocessen spawnen om multi-core computers te gebruiken. Het slaat modellen, simulatieparameters en simulatie-resultaten op in een XML-formaat. Bovendien kunnen SBML-modellen worden geïmporteerd en geëxporteerd. De modellen en simulatieparameters kunnen worden gelezen van invoerbestanden of bewerkt in het programma. De GUI (grafische gebruikersinterface) is geschreven in Python en gebruikt de WXPYTHON Toolkit. De solvers worden geïmplementeerd als opdrachtregelbestemmingen, geschreven in C ++, die worden aangedreven door CAIN. Dit maakt het gemakkelijk om batchtaken te lanceren. Het vereenvoudigt ook het proces van het toevoegen van nieuwe oplossers. Cain biedt een verscheidenheid aan solvers: - Gillespie's directe methode.- Gillespie's eerste reactiemethode.- Gibson en Bruck's volgende reactiemethode.- Tau-springend.-- Hybrid Direct / Tau-Spring.- Ode-integratie. Wat is er nieuw in deze release: · Verbeterde documentatie. · Eenvoudige oplossers voor inhomogene problemen. · Histogramoplossers die nu het gemiddelde en de variantie registreren. · Verbeterde taakplanning. · Verbeterde bestandsindelingen. · Refactoring om toekomstige ontwikkeling te helpen.

Kaïn Gerelateerde software