MassiPEC :: CUIDIGEN

MassiPEC :: CUTIFICES is een PERL-verlenging met C-hulpprogramma's voor gebruik in massaspectrometrie.
Download nu

MassiPEC :: CUIDIGEN Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Perl Artistic License
  • Prijs:
  • FREE
  • Naam uitgever:
  • Jonathan Epstein
  • Uitgever website:
  • http://search.cpan.org/~jaepstein/MassSpec-CUtilities-0.04/CUtilities.pm

MassiPEC :: CUIDIGEN Tags


MassiPEC :: CUIDIGEN Beschrijving

MassiPEC :: CUTI's is een Perl-uitbreiding met C-nutsbedrijven voor gebruik in massaspectrometrie. MassiPEC :: CUARIFILIERINGEN is een PERL-extensie met C-nutsbedrijven voor gebruik in massaspectrometrie.synopsismassspec :: CUTIFICES is een XS-module, dus er is een kans dat u of uw doelgebruiker het mogelijk niet op het doelsysteem installeert; Daarom wordt aanbevolen om zijn aanwezigheid optioneel te maken en een langzamere presterende PERL-equivalenten aan te bieden waar praktisch opmerkt dat deze module een 19-letter-amino-alfabet gebruikt in plaats van het traditionele 20-letterige alfabet, sinds de isobars Leucine (L) en Isoleucine ( I) worden in plaats daarvan weergegeven door "X." Verder gaan sommige delen van deze module ervan uit dat hun invoerpeptiden intern in alfabetische volgorde zijn. mijn $ havecuuties; Als (EVAL 'MassSpec vereist :: CUSI's') {Import MassSpec :: CUARIFICES; $ havecuuties = 1; } anders {$ havecuuties = 0; } if ($ HAVECUTIES) {My $ Candidate = MassSpec :: CUARIFICES :: ENCODEASBITSTRING ("ACCGTT"); mijn @shortpeptides = ("ACT", "CCGM", "Accgty", "CCT"); mijn (@ lijst, @ antwoord); Foreach $ _ (@shortepeptides) {Push @list, MassSpec :: CUARIFICES :: ENCODEASBITSTRING ($ _); } If (MassSpec :: CUTIFICES :: TestmanyBitstrings ($ kandidaat, @ Shortpeptides, @ lijst, @ antwoord)) {# moet "Act" en "CCT" alleen afdrukken "aangepast:". Word lid (',', @ antwoord). "N"; }} Zie API-documentatie voor andere beschikbare SubroutinesabStracte Eclectische Mix van C-nutsvoorzieningen die oorspronkelijk worden gebruikt in een massaspectrometrie Denovo Sequencing-project bij NIH. Het bevat een snelle Huffman-decoder Geschikt (met kleine wijzigingen) voor gebruik met het CPAN-module-algoritme :: Huffman, evenals een snelle peptide-massacalculator en -methoden voor het coderen van peptiden als producten van prime-nummers of als bitmaps.an eclectische mix van C Hulpprogramma's die oorspronkelijk worden gebruikt in een massaspectrometrie Denovo Sequencing-project bij NIH. Het bevat een snelle Huffman-decoder Geschikt (met kleine wijzigingen) voor gebruik met het CPAN-module-algoritme :: Huffman, evenals een snelle peptide-massacalculator en -methoden voor het coderen van peptiden als producten van prime-nummers of als bitmaps. Vereisten: · Perl


MassiPEC :: CUIDIGEN Gerelateerde software