Mud MDR is ontwikkeld om de detectie, karakterisering en interpretatie van gen-gen-interacties of epistasis te vergemakkelijken.
Download nu

Mud Rangschikking & Samenvatting

Mud Tags

gen Gene-gen-interacties gen-genepistase induction algoritme interacties epistasis

Mud Beschrijving

MDR is ontwikkeld om de detectie, karakterisering en interpretatie van gen-gen-interacties of epistasis te vergemakkelijken. MDR is ontwikkeld om de detectie, karakterisering en interpretatie van gen-gen-interacties of epistasis te vergemakkelijken. Het maakt gebruik van een nieuw constructieve inductionalgoritme om niet-lineaire interacties onder discrete kenmerken te detecteren. Wat is MDR? Multifactor dimensionaliteitsreductie (MDR) is een niet-parametrisch en genetisch modelvrij alternatief voor logistieke regressie voor het detecteren en karakteriseren van niet-lineaire interacties onder discrete genetische en milieuattributen. De MDR-methode combineert attribuutselectie, kenmerkconstructie, classificatie, kruisvalidatie en visualisatie om een uitgebreide en krachtige datamining-benadering te verschaffen voor het detecteren, kenmerken en interpreteren van niet-lineaire interacties. Vereisten: · Java Runtime Environment (JRE) 1.5 of nieuwer · Java Hotspot Client VM (Build 1.4.2_06-B03, gemengde modus) Wat is er nieuw in deze release: · Fix opgeslagen analyse-uitgangsbug. In het gedeelte '@resultaten' voor elk model, waarbij de training en het testen van verwarringsmatrix worden uitgevoerd voor elke cross-validatietest, was het testen onjuist - het was de opleidingsverwarringmatrix die wordt herhaald in plaats van de testmatrix. De gemiddelden in de lijn met 'AvgTrain' waren correct, dus de algehele training en testcuraties waren nog steeds beschikbaar. · Fix bug waar het laden van een analyse en vervolgens opnieuw opsparen, zou het een null-aanwijzing uitzondering veroorzaken. · Eenvoudigste oplossing, hoewel niet ideaal, was om SAVE-analyse uit te schakelen wanneer een oude analyse is geladen. · Als een nieuwe analyse wordt uitgevoerd, wordt de knop 'Save Analysis' als gebruikelijk ingeschakeld. Als een kopie van een bestaande analyse nodig is, kan het buiten MDR worden gedaan.

Mud Gerelateerde software