Nebgbist

Annotatiegeschiedenissen van Genbank-bestanden.
Download nu

Nebgbist Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • MIT/X Consortium Lic...
  • Prijs:
  • FREE
  • Naam uitgever:
  • Paul Joseph Davis
  • Uitgever website:
  • http://github.com/davisp/

Nebgbist Tags


Nebgbist Beschrijving

Annotatie-geschiedenissen van Genbank-bestanden. Nebgbist bevat gereedschappen voor het bouwen van annotatiegeschiedenissen van meerdere Genbank-bestanden.Example: $ MKDIR GBHIST $ NEB-REV-REV-FETCH -D GBHISH NC_008512 $ NEB-GBHIST -D GBHIST | NEB-DIFF-TOEPASSING NC_008512.GIT $ GIT --GIT-DIR = NC_008512.GIT GC --aggressieve $ NEB-validate-History -P NC_008512.Git -G GBHist / 2009-04-29-04-04.GBKPlaying met Bestands Als u de repository van de verpakking kunt klonen na het bouwen kunt u op de inhoud op het bestandssysteem porren. Voor grotere genomen met veel bewerkingen kan dit afoul van directory-invoerlimieten uitvoeren totdat ik de objectopslag herschreven. Voor de Carsonella (NC_008512) Voorbeeld Ik gebruik er geen probleem. $ Git clone nc_008512.git $ CD NC_008512 $ LS -1Accession DBLINK Trefwoorden Objecten / SEQ / VersieCommentement Definitie Locus Ref / SourceFiles in de hoofddirectory weergeven Trefwoorden weergeven in de Genbank-bestand. De subdirectories van REF en SEQ bevatten informatie over referenties en de sequentiehashes. De objecten voor objecten bevat de functies in de geschiedenis. De bestanden objecten / bekende en objecten / leven zijn woordenboeken van hashes die wijzen op de huidige versie van een functie op een bepaalde locatie. Actieve functies zijn alles wat niet wordt verwijderd of vervangen door een nieuwe versie.Developer COMMERSIONA Beveel je aan met Nebpack.pack-objecten als je echt iets met de objecten wilt doen. Vereisten: · Python


Nebgbist Gerelateerde software