Obitools Scripts en bibliotheek voor biologische sequentie-analyse
Download nu

Obitools Rangschikking & Samenvatting

Obitools Tags

Python-bibliotheek analys reeks biologisch biologische sequentieanalyse

Obitools Beschrijving

Scripts en bibliotheek voor biologische sequentie-analyse Obitools is een set van Python-scripts die is gemaakt om manipulatie van sequentiebestanden in onze laboratoria te vereenvoudigen. Ze waren vooral ontwerpen om ons te helpen tijdens analyse van de volgende generatie sequencer-uitgangen (454 of Solexa). Deze scripts vertrouwt op een Python-bibliotheek met dezelfde naam '' Obitools''the-bibliotheek en de scripts evolueerden met onze behoeften. Ze bieden voornamelijk faciliteiten om sequentiebestanden in FASTA-indeling te manipuleren. Andere indelingen worden ondersteund als Genbank of EMBL.The '' 'Obitools' 'Scriptthe Obitools-scripts wil je helpen om verschillende gegevens- en sequentiebestanden op een handige manier te manipuleren met behulp van de interface van de UNIX-opdrachtregel. Ze volgen de standaard Unix-interface voor het opdrachtregelprogramma, zodat een set scripts met behulp van de pijpmecanisme kan worden gekoppeld. Al deze scripts hebben een---optie die een kleine online-hulp afdrukken om de verschillende opties die door het script worden geaccepteerd te beschrijven. Als een optie is Gedeeld door verschillende scripts, wordt deze optie door dezelfde letter in al deze scripts genoemd. Dit wordt gedaan om het gebruik van de scripts van Obitools te vergemakkelijken. Op dezelfde manier begint de naam van een script met een voorvoegsel dat het formaat van het invoerbestand aangeeft. De '' 'Obitools' '' Python Libraryobitools is een set scripts, maar ook een Python-bibliotheek. U kunt deze bibliotheek vrij gebruiken om uw eigen scripts te maken. Vereisten: · Python

Obitools Gerelateerde software